酵母菌胞溶产物提取物总dna提取方案

细菌DNA提取方案:革兰氏阴性菌,如E.coli;一、水煮模板法――主要用于PCR反应;1、接种单菌落于LB或脑心平板,连续画线,37摄;2、刮取1~2接种环菌苔加入150微升三蒸水中,;3、12000转/分钟离心10分钟,取上清,-2;操作最简便,对试剂条件要求低;有人称扩增4kb以下片段都可用此种方法制取模版,;二、CTAB/NaCl法;1、接种一单菌落
细菌DNA提取方案:革兰氏阴性菌,如E.coli,一般有三种可以选择的方法。
一、水煮模板法――主要用于PCR反应
1、接种单菌落于LB或脑心平板,连续画线,37摄氏度培养18-24小时。
2、刮取1~2接种环菌苔加入150微升三蒸水中,混匀,100摄氏度煮沸10分钟。
3、12000转/分钟 离心10分钟,取上清,-20摄氏度保存备用。
操作最简便,对试剂条件要求低。缺点是纯度不够高,可能会含有RNA、蛋白等杂质。但是作为一般检测目的的PCR反应模板已经足够了。
有人称扩增4kb以下片段都可用此种方法制取模版,编者用此类模板PCR可以扩增到3500bp的片段。编者建议:此法得到的模版保存时间短,强烈建议每月重新制作一次。
二、CTAB/NaCl 法
1、接种一单菌落于5mlLB中,30℃培养过夜,
2、取1ml种子培养液接入100ml2%LB中,37℃、220r/min培养16小时;
3、5000r/min离心10分钟,弃去上清。
4、加入10mlTE离心洗涤后,用10mlTE溶解菌体,混匀,-20℃保存备用。
5、取3.5ml菌悬液,加入184μl10%SDS,混匀,加入37μl10mg/ml蛋白酶K,混匀,37℃温育1小时
6、加入740μl5mol/LNaCl,再加入512μlCTAB/NaCl,混匀,65℃温育10分钟。
7、加入等体积的氯仿/异戊醇,混匀,10000r/min离心5分钟,保留上清。
8、上清中加入等体积的酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1),混匀,10000r/min离心5分钟,保留上清。
9、加入0.6倍的异丙醇,混匀,10000r/min离心5分钟,收集DNA沉淀,用70%乙醇离心洗涤DNA沉淀。
10、用1mlTE溶解DNA,加入终浓度为20μg/mlRNaseA,4℃保存。
CTAB/NaCl法提取的DNA纯度较高,蛋白杂质较少,保存时间长,编者更喜欢把终浓度为20μg/ml RnaseA加在第5步温育的时候,这样最后没有RnaseA污染。每一步操作细致一些,得到的DNA可
用于Southern blot。
编者建议:长时间保存DNA可放于-20℃,但要尽量减少反复冻融,否则影响DNA质量。
三、盐析法
1、1.5ml对数期菌液
2、12000rpm 30 s
3、200ul裂解液(同CTAB/NaCl法),37c,1hr
4、66ul 5M NaCL,混匀充分,12000rpm 10min
5、上清用粗枪头取至新管
6、等体积酚充分混匀,12000rpm 3min,反复抽提至无蛋白层
7、取水层,等体积氯仿混匀,12000rpm 3min
8、上清至新管,2倍体积预冷无水乙醇
9、-20C,20min,14000rpm, 15min
10、400ul 70%冷乙醇洗涤
11、干燥,100ul 20ug/ml RNaseA,37C,30min
12、2倍体积无水乙醇沉淀,70%冷乙醇洗涤
13、干燥,溶于100ul TE
介于方法一和方法二之间,CTAB虽然取出糖分效果较好,但CTAB本身也是有毒的,所以此方法放弃了CTAB。
革兰氏阳性菌,由于细胞壁的结构与阴性菌有差别,裂解比阴性菌稍微麻烦一些,可以采取CTAB/NaCl法稍加修改,在第四步加入终浓度2mg/ml的溶菌酶,37度温育1h。
实验注意:提基因组最好要将枪头尖剪掉(剪掉以后在酒精灯上迅速过一下,使其断口圆滑)。以免枪头损伤基因组!抽干时最好是风干!
较精细的实验,如Southern,强烈推荐用试剂盒!
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酵母基因组DNA简易高效提取方案
1. 10ml菌液过夜培养至饱和(OD600值为2-3)
2. 离心沉降细胞(Sorvall中以2000rpm的速度),然后以冷的、等体积的无菌蒸馏水洗涤
3. 将细胞沉淀在200μl 裂解缓冲液中重悬浮,然后加入约300μl 玻璃珠和200μl的1:1苯酚:氯仿混和液
4. 漩涡摇匀1-2min
5. 加入200μl的 TE缓冲液,倒置混合6-10次。注意:从这步开始漩涡摇匀可能会剪切DNA
6. 在微型离心机中以13000rpm的速度离心样品5min
7. 将上层的水相转移到干净的微量离心管中
8. 加入1体积(400μl)氯仿并翻转混合mix by inversion
9. 同第6步离心
10. 将上层的水相转移到新的微量离心管中
11. 加1ml乙醇,翻转混匀
12. 在微型离心机中以13000rpm的速度离心2min
13. 弃上清液,用1ml的70%乙醇洗涤沉淀
14. 完全弃去上清液,并将沉淀在室温下干燥。在干燥过程中沉淀颜色会发白但无酒精味
15. 在 400μl 含有最后浓度为2μg/ml的 核糖核酸酶的TE 缓冲液中重悬浮沉淀 16. 37℃培养10min
17. 重复9-12步
18. 在 50μl TE中重悬浮沉淀
裂解缓冲液: 2%(v/v)Triton X-100, 1%(v/v)SDS, 100mM NaCl, 10mM Tris 碱(pH8.0), 1mM EDTA(pH8.0)
TE缓冲液: 10mM Tris碱(pH8.0), 1mM EDTA(pH8.0)
YPD: 1%酵母浸膏, 2%细菌用蛋白胨,2%葡萄糖, 20min/升 高压灭菌
酸洗玻璃珠: 425-600μm,Sigma公司,G8772,使用前高压灭菌
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随时随地聊科研请问中量/大量酵母基因组DNA提取试剂盒 (溶液型)在实验时需要注意啥啊?
苏格拉丶澈738
博凌科为中量/大量酵母基因组DNA提取试剂盒 (溶液型)为特别研制的酵母DNA提取试剂盒,采用特殊处理的吸附柱以及独有的溶液系统,从各种来源的酵母培养物中快速而高效的提取DNA.获得的DNA纯度高,产量稳定.
每次可处理3-5 x 108个酵母细胞,可直接用于PCR、酶切以及杂交等试验. 试剂盒特点:◆
产量高:3ml指数生长期的酵母培养液可提取10-15μg的高质量的基因组DNA.◆
纯度高:OD260/OD280典型的比值达1.7-1.9.◆
重现性好:柱与柱间吸附量差异极小,克服国产试剂盒膜质量不稳定的弊端.◆
操作安全:无需乙醇沉淀步骤,不需要使用有毒的苯酚等试剂.
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