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&&求助啊，懂的帮我看一下有错误没有，check cif
求助啊，懂的帮我看一下有错误没有，check cif
最近测了一个晶体结构，之前发现传了CHECK CIF生成的报告期中A类错误比较多，后来让别人给修了一次，报告里还是有A类错误，但是他说已经修好了
大家帮我看一下，这些是不是不需要修正的错误，接触这个不不久，求指教。
下面是生成的CIF报告：
Alert level A
EXPT005_ALERT_1_A _exptl_crystal_description is missing
Crystal habit description.
The following tests will not be performed.
EXPT010_ALERT_1_A _exptl_crystal_colour (_pd_char_colour for powder) is missing
Crystal colour.
The following tests will not be performed.
DIFF005_ALERT_1_A _diffrn_measurement_method is missing
Mode of intensity measurement and scan.
DIFF019_ALERT_1_A _diffrn_standards_number is missing
Number of standards used in measurement.
DIFF020_ALERT_1_A _diffrn_standards_interval_count and
_diffrn_standards_interval_time are missing. Number of measurements
between standards or time (min) between standards.
DIFF022_ALERT_1_A _diffrn_standards_decay_% is missing
Percentage decrease in standards intensity.
checkCIF publication errors
Alert level A
PUBL004_ALERT_1_A The contact author’s name and address are missing,
_publ_contact_author_name and _publ_contact_author_address.
PUBL005_ALERT_1_A _publ_contact_author_email, _publ_contact_author_fax and
_publ_contact_author_phone are all missing.
At least one of these should be present.
PUBL006_ALERT_1_A _publ_requested_ is missing
e.g. ’Acta Crystallographica Section C’
PUBL008_ALERT_1_A _publ_section_title is missing. Title of paper.
PUBL009_ALERT_1_A _publ_author_name is missing. List of author(s) name(s).
PUBL010_ALERT_1_A _publ_author_address is missing. Author(s) address(es).
PUBL012_ALERT_1_A _publ_section_abstract is missing.
Abstract of paper in English.
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谁能帮我解决一下这两个晶体结构check cif 的A类错误吗？急，不胜感激。
第一个结构
PLAT241_ALERT_2_A Check High Ueq as Compared to Neighbors for C18
PLAT241_ALERT_2_A Check High Ueq as Compared to Neighbors for N13
PLAT241_ALERT_2_A Check High Ueq as Compared to Neighbors for C21
PLAT242_ALERT_2_A Check Low Ueq as Compared to Neighbors for Ni13
PLAT242_ALERT_2_A Check Low Ueq as Compared to Neighbors for C22
PLAT093_ALERT_1_B No su's on H-atoms, but refinement reported as . mixed
PLAT201_ALERT_2_B Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) ....... 5
PLAT213_ALERT_2_B Atom C7 has ADP max/min Ratio ..... 4.9 prola
PLAT241_ALERT_2_B Check High Ueq as Compared to Neighbors for C7
PLAT241_ALERT_2_B Check High Ueq as Compared to Neighbors for C17
PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O1W
PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O2W
PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O3W
第二个化合物
PLAT201_ALERT_2_A Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) ....... 36
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 10.0 Ratio
PLAT234_ALERT_4_A Large Hirshfeld Difference Ni18 -- N6 .. 0.39 Ang.
PLAT234_ALERT_4_A Large Hirshfeld Difference Ni14 -- O4W .. 0.33 Ang.
PLAT241_ALERT_2_A Check High Ueq as Compared to Neighbors for C6
PLAT241_ALERT_2_A Check High Ueq as Compared to Neighbors for C7
PLAT241_ALERT_2_A Check High Ueq as Compared to Neighbors for C29
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谁能帮我解决一下这两个晶体结构check cif 的A类错误吗？急，不胜感激。
第一个结构
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PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O2W
PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O3W
第二个化合物
PLAT201_ALERT_2_A Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) ....... 36
PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 10.0 Ratio
PLAT234_ALERT_4_A Large Hirshfeld Difference Ni18 -- N6 .. 0.39 Ang.
PLAT234_ALERT_4_A Large Hirshfeld Difference Ni14 -- O4W .. 0.33 Ang.
PLAT241_ALERT_2_A Check High Ueq as Compared to Neighbors for C6
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PLAT241_ALERT_2_A Check High Ueq as Compared to Neighbors for C29
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扫描下载送金币问题：；_diffrn_measured_fractio；采集数据的完成度偏低，通常要在0.97以上；问题：；Nosu'sonH-atoms,butrefin；报告中显示对H原子的修正方法是混合模式但没有列出；问题：；CIFContainsnoX-HBonds...；CIFContainsnoX-Y-HorH-Y-；问题：；PLAT080_ALERT_2_A
问题： _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......
0.93 采集数据的完成度偏低，通常要在0.97以上。最好是重新收集数据。 解决方法：omit 0 50
问题： No su's on H-atoms, but refinement reported as .
报告中显示对H原子的修正方法是混合模式但没有列出H原子相关的偏差。 解决方法：把.CIF中的 \改成 \就可以了。
问题： CIF Contains no X-H Bonds ......................
? CIF Contains no X-Y-H or H-Y-H Angles ..........
? 解决方法：在ins 文件中将Bond改为Bond $h 命令,再在XL中精修一下就可以了
问题： PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................ 0.37 修正轮数不够多 Maximum Shift/Error 值应该接近于0，至少要在0.02以下。 解决方法：增加修正轮数（L.S. 后的数值改大）
问题： PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent O Ueq(max)/Ueq(min) ... 7.95 Ratio PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent H Ueq(max)/Ueq(min) ... 7.78 Ratio 这二条是指原子有较大的非正定，说明没有修正好。 解决方法：可以考虑将这个有较大无序的O进行分比（如占位率0.5：0.5）再修。 如果是衍射数据质量不够好而无法得到好的修正结果，那只有重新采集数据了。
问题： DENSX01_ALERT_1_A
The ratio of the calculated to measured crystal density
lies outside the range 0.80
Calculated density =
Measured density
0.000 PLAT093_ALERT_1_A No su's on H-atoms, but refinement reported as .
mixed 解决方法：在cif里将_exptl_crystal_density_meas
0 改为：_exptl_crystal_density_meas
将_refine_ls_hydrogen_treatment
mixed 改为：_refine_ls_hydrogen_treatment
问题： PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C3
is NPD .....................
? 解决方法：原子非正定，无序或者空间群错误， 或者数据不好。这个原子如果在结构中不甚重要，可以按各向同性处理，一般不影响发表 。用ISOR命令各向同性，应该可以解决。
问题： Hirshfeld Test Diff for
解决方法：ins文件里加入 delu 0.02 c1 c2
限制所指定的原子具有接近指定范围内的位移参数）
问题： PLAT052_ALERT_1_A (Proper) Absorption Correction Method Missing ..
? PLAT057_ALERT_3_C Correction for Absorption Required
RT(exp) ...
1.11 解决方法：主要注意cif文件中的以下这几行，_exptl_absorpt_correction_type 这一项只要做了xcif就一般会自动填 'Multi-scan'，你也可根据自己的校正方法来填。 一般可能出的问题就是这几行填得串了行，或者T_min 与T_max 填反了。仔细检查
问题： PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent
Ueq(max)/Ueq(min) ...
3.83 Ratio 解决方法：simu 0.01 0.02 3.8 $c （simu
限制在一定范围内的原子具有相同的位移参数）
问题： 解完晶体后check cif出现A类错误No s.u. Given for Flack Parameter ..............
不知道如何解决 解决方法：你这个结构是否有手性？ 1. 如果有手性且有重原子，那在修正中加入Flack指令，修正后重新产生CIF。 2. 如果没有手性，或有手性但用Mo靶做小于Si元素的结构，则可在CIF的原子信息这一栏的最后面添加一句话，如下所示： _chemical_formula_sum
'C10 H18 O5 ' _chemical_formula_moiety
'C10 H18 O5 ' _chemical_formula_weight
218.25 _chemical_melting_point
? _chemical_absolute_configuration
' unk ' 这样就可以了
问题： 一个B类错误：Merging of Friedel Pairs is STRONGLY Indicated 解决方法：在ins文件中加入MERG 3重新精修一轮即可。
问题： ABSTM02_ALERT_3_A
Test not performed as the _exptl_absorpt_correction_type has not been identified. See test ABSTY_01.
解决方法：The absorption correction should be one of the following
analytical
integration
multi-scan
问题： Alert level A PLAT031_ALERT_4_A Refined Extinction Parameter within Range ......
0.00 Sigma Alert level B PLAT232_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff (M-X)
PLAT232_ALERT_2_B Hirshfeld Test Diff (M-X)
12.23 su 解决方法：第一个问题在INS文件中把EXTI这行命令删掉再修就可以了 后两个B类错误可以在-lst文件中BOND的下一行使用如写命令，然后精修： ELMU Zn O1 Zn O2 SIMU 0.007 0.001 Zn O1 Zn O2
附： 关于CIF检测中出现的A,B等类错误的说明
一般分为8类，分别为： # _0xx - general # _1xx - cell/symmetry # _2xx - adp-related # _3xx - intra geometry # _4xx - inter geometry # _5xx - coordination geometry # _6xx - void tests # _7xx C various test 下面我们分几次把问题的简要说明翻译成献给大家，希望能对您有所帮助！
_201 检测分子结构主体中各向同性的非氢原子，各向同性在通常的精修中并不常用，只是在处理无序是才用到。
_202 检测溶剂分子或阴离子中各向同性的非氢原子
_211 检测主体分子的NPD ADP's 。检测主体分子中各相异性参数中负值部分（NPD is non-positive displacement ）
_212 检测溶剂或阴离子分子的NPD ADP's 。检测溶剂或阴离子分子中各相异性参数中负值部
_213 主体分子中ADP maximum/minimum 比例检测，较大的值意味着无序没有处理。
_214 溶剂或阴离子中ADP maximum/minimum 比例检测，较大的值意味着无序没有处理。
_220 检测主体结构非氢原子Ueq(max)/Ueq(Min)范围。对比平常之大的比值发出警报。太高或太低的值表明原子可能定错(i.e. Br versus Ag)
_221 检测非主体结构非氢原子Ueq(max)/Ueq(Min)范围。对比平常之大的比值发出警报
_222 检测主体结构氢原子Ueq(max)/Ueq(Min)范围。对比平常之大的比值发出警报
_223 检测非主体结构氢原子Ueq(max)/Ueq(Min)范围。对比平常之大的比值发出警报
_230, _233 : Hirschfield 刚性键检查。相近化学特征的原子应具有相同程度的各相异性参数，无序或过度精修可能会导致大小不一。原子的错误判定也会有这样的结果。DELREF 技术 (e.g.DIFABS, SHELXA, XABS2) 校正的数据通常对含重原子的键有较大的 DELU 值
_241, _242 检测相对于相邻原子过高或过低的U(eq)值。原子的U(eq) 值会被拿去与所有非氢原子的平均U(eq)去比较，如果值太大，可能是原子定错了。
_013 : 检测报告与衍射范围和数据的完整度 _020 : 检测 R(int)。R(int)最好小于0.1。但是基于非常有限数量的平均数据的R(int) 没什么意义 _021 : 检查 观测衍射数目/期望数目的比值 期待数目对应于劳埃群的不对称单元中的数目。对于中心对称的结构，期望币值为小于或等于1.0;对于非中心对称结构则小于2。超过这些数据可能是：对称性消光没有从观测数据中消除或采用过多的数据进行精修 _022 :检测完整度，检测报道的独立衍射点与期望的给定的分辨率 _023 : Check θmax。检测分辨率。当sin (θ)/λ <0.6时，发布警告。 _024 : 检测优化的平均Friedel 对。对于含有比硅轻的原子的MoKa 数据，平均Friedel 对是优先的。SHELXL97 精修中采用MERG 4。 _025 : 检查 h,k,l范围 _026 : 检查弱点，检查2σ以上的独立数据的衍射是否充分 _030 检测精修的消光参数是否有意义，检测它的值是否明显大于相应的s.u。如果不是，这个参数应从结构模型精修中删除。目前默认值为3.33 s.u _032 检测Flack 参数的S.U.
_033 检测Flack参数偏离零的程度，即检查绝对构型的正确性。 _040 检查化合物中碳原子上是否有氢原子 _041 比较报道的与计算的总分子式Compare the Reported and Calculated Sum Formula _042 比较报道的与计算的残基分子式Compare the reported and Calculated Moiety Formula _043 比较报道的和计算的分子量Compare Reported and Calculated Molecular Weight _044 比较报道的和计算的分子量密度 _045 比较报道的和计算的Z值 _046 检测报道的Z, MW, D(calc) 是否一致 _050 检测给出的mu值
_051 测试报道的和计算的mu 的差别。
_052 测试吸收校正方法的条件 _053 测试晶体尺寸最小值xtal_dimension_min的条件 _054 测试晶体尺寸中间值
_055 测试晶体尺寸最大值 三亿文库包含各类专业文献、高等教育、中学教育、行业资料、幼儿教育、小学教育、check-cif常见a类错误解答60等内容。　
　check-cif常见错误解决_化学_自然科学_专业资料。Check...(A) 0.224 0.202 0.266 1.27 1.37 1.38 将...精修后仍有该类错误,但数值由 8.0 将为 7.5 2... 　麻烦给解答一下 谢谢! PLAT222_ALERT_3_A Large Non-Solvent H Ueq(max)/...check-cif常见a类错误解... 7页 免费 单晶结构解析讲义完美版 34页 2下载券... 　013-精修A,B类错误的技巧_化学_自然科学_专业资料...Check Low Ueq as Compared to Neighbors for Cu2...? 对策:在 Cif 文件中添加 _chemical_absolute_... 　A类错误解释-1 暂无评价 8页 1财富值 建筑名词解释...单晶检查错误解释单晶检查错误解释隐藏&& CIF-VALIDATION...the file &#39;check.def&#39; and implemented in PLATON... 　LGEHZ-C- OSCIFT COIL 检查规格_电子...(审)A) LG电子 LGEHZ(审)A4003(...CHECK 检查 CHECK 检查 CHECK 检查 CHECK 检查 2 ...请各位大侠帮忙处理一下晶体A ,B类错误，谢谢(晶体,计算机) - 有机|无机化学 - 生物秀
标题: 请各位大侠帮忙处理一下晶体A ,B类错误，谢谢(晶体,计算机)
摘要: Click on the hyperlinks for more details of the test --------------------------------------------------------------------------------Alert level ADIFMX01_ALERT_2_AThe maximum difference density is >……
Click on the hyperlinks for more details of the test.
--------------------------------------------------------------------------------Alert level A
DIFMX01_ALERT_2_AThe maximum difference density is > 0.1*ZMAX*2.00
_refine_diff_density_max given = 11.086
Test value = 10.600
SHFSU01_ALERT_2_AThe absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
Absolute value of the parameter shift to su ratio given 1.087
Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................
PLAT097_ALERT_2_A Large Reported Max.(Positive) Residual Density
11.09 eA-3
--------------------------------------------------------------------------------Alert level B
PLAT241_ALERT_2_B Check High
Ueq as Compared to Neighbors for
PLAT721_ALERT_1_B Bond
Calc 0.96000, Rep 0.98520 Dev...
C5 -H5A 1.555 1.555
PLAT721_ALERT_1_B Bond
Calc 0.96000, Rep 0.98530 Dev...
C5 -H5B 1.555 1.555
PLAT721_ALERT_1_B Bond
Calc 0.96000, Rep 0.98520 Dev...
C5 -H5C 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc
110.00, Rep
112.60 Dev...
N3 -C5 -H5A 1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc
110.00, Rep
112.60 Dev...
N3 -C5 -H5B 1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc
109.00, Rep
106.20 Dev...
H5A-C5 -H5B 1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc
110.00, Rep
112.60 Dev...
N3 -C5 -H5C 1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc
109.00, Rep
106.20 Dev...
H5A-C5 -H5C 1.555 1.555 1.555
PLAT722_ALERT_1_B Angle Calc
109.00, Rep
106.20 Dev...
H5B-C5 -H5C 1.555 1.555 1.555
143网友回复这个是不是也可以问问计算机好的同学啊！让人家给看看，！网友回复 引用内容:
这个是不是也可以问问计算机好的同学啊！让人家给看看，！ 你好，你是哪个专业的？网友回复不研究这个网友回复PLAT097_ALERT_2_A Large Reported Max.(Positive) Residual Density
11.09 eA-3
你的晶体数据是不是还没有处理完全啊 Q值这么大，可能还有别的东西了吧网友回复PLAT241_ALERT_2_B Check High
Ueq as Compared to Neighbors for
你试试 simu 0.01 0.02 3.8 $Ag网友回复 引用内容:
不研究这个 骗BB吧？网友回复 引用内容:
骗BB吧？ ？？？
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