运行时间主要消耗在对角化上
,影响不是特别大可选
,可选节点数取值越大,内存占用越多并行效率总是低于
线性叠加效率的,核越多并行效率越低所以对于┅定核(如
个核)比先后算(每个作业
控制赝势能量的非局域部分如何计算
如果用集群算,可以考虑让
空间计算量正比于平面波数目
实涳间计算依赖体系大小。
为总核数核数很多时(
,这个参数的影响比较大
做分子动力学的好处由于
是近些年开发的比较成熟的软件,在做电
速度方面有较好的优势
尽管如此,对于大多数有关分子动力学的任务还是可以胜任的
下面我将对主要参数进行介绍!
一般做分子动力学的时候都需要较多原子,一般都超过
点实际就需要较少了有的时候用一个
这个参数只是对第一个離子步的
对于长时间的分子动力学的模拟,
对于原子数较多,这个优化方式较好
多少个时间步长,写一次
终态温度不设的话,等于
結构弛豫的判据一般有两种选择:
力也应该是收敛到平衡态的
但是数值计算过程上的差异导致以
二者为判据的收敛速度差异很大,
力收斂速度绝大部分情况下都慢于能量收敛速
这是因为力的计算是在能量的基础上进行的
能量对坐标的一阶导数得到力。
计算量的增大和误差的传递导致力收敛慢
到底是以能量为收敛判据,
还是以力为收敛判据呢关心能量的人,
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