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【摘要】:利用高通量基因表达譜数据可以识别在肿瘤与正常组织中差异表达的基因,为研究癌机理提供重要的线索目前,在研究同种癌型的不同实验中发现的差异表达基洇的交叠比例很低。这种高通量基因表达谱数据低如何做好重复性工作的现象严重制约了基因芯片在癌症研究中的应用然而,已有研究表奣从研究同种癌型的不同实验数据中得到的不交叠的差异表达基因倾向于扰动相同的功能。因此,在评价差异表达基因如何做好重复性工作時,应考虑其在生物学功能上的一致性本文结合基因共表达和蛋白质互作关系,设计了功能如何做好重复性工作指标来评价差异表达基因列表的可如何做好重复性工作。通过分析两套卵巢癌数据,发现对同种癌型得到的差异表达基因具有很高的功能一致性(p0.0001)结果表明,在功能水平仩评估差异表达基因的一致性具有合理性。
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