安装mpich2时如何产生mpicc及mpifort - 实验交流 - 生物秀
标题: 安装mpich2时如何产生mpicc及mpifort
摘要: [安装mpich2时如何产生mpicc及mpifort] mpich2安装好了之后没有mpicc或者mpifort啊，怎么办，下一步单机并行编译的时候需要这个东西啊，看了网上很多帖子，还是没有弄明白，大家怎么让icc成为mpicc及ifort成为mpifort的，不会是做个软链接吧，我太菜了看不懂啊:tiger08:也就是如何让mpicc认定自己链接的是 关键词:[利用率]……
mpich2安装好了之后没有mpicc或者mpifort啊，怎么办，下一步单机并行编译的时候需要这个东西啊，看了网上很多帖子，还是没有弄明白，大家怎么让icc成为mpicc及ifort成为mpifort的，不会是做个软链接吧，我太菜了看不懂啊:tiger08:
也就是如何让mpicc认定自己链接的是icc，还是gcc，及mpifort链接的是ifort还是gfortran
谢谢了回复
mpich2安装好了之后没有mpicc或者mpifort啊，怎么办，下一步单机并行编译的时候需要这个东西啊，看了网上很多帖子，还是没有弄明白，大家怎么让icc成为mpicc及ifort成为mpifort的，不会是做个软链接吧，我太菜了看 ... (1) 先安装mpich or opemmpi
(2) 在 configure or make 你的C++或者FORTRAN的时候, 加上一些参数. 加什么, 怎么加, 参见你的编译器的manual.
比如, Intel C++, V11.0, 针对openmpi编译的时候, 加上的是:
-openmp-lib compat
你可以试试看.回复
(1) 先安装mpich or opemmpi
(2) 在 configure or make 你的C++或者FORTRAN的时候, 加上一些参数. 加什么, 怎么加, 参见你的编译器的manual.
比如, Intel C++, V11.0, 针对openmpi编译的时候, 加上的是 ... 您的意思是在configure或者make的时候，加上一定的选项，定义mpicc是icc还是ifort的，我理解的对么，具体的设置需要看这个openmpi或者mpi的manual，是么回复
您的意思是在configure或者make的时候，加上一定的选项，定义mpicc是icc还是ifort的，我理解的对么，具体的设置需要看这个openmpi或者mpi的manual，是么 正解.回复
您的意思是在configure或者make的时候，加上一定的选项，定义mpicc是icc还是ifort的，我理解的对么，具体的设置需要看这个openmpi或者mpi的manual，是么 我记得,如果是mpich1.2.5的话, 如果是PGI Fortran, 这么做:
# ./configure --enable-debug -fc=pgf77,-f90=pgf90
具体查查manual就好了, Fortran和MPICH的manual都要查查, double check回复
我记得,如果是mpich1.2.5的话, 如果是PGI Fortran, 这么做:
# ./configure --enable-debug -fc=pgf77,-f90=pgf90
具体查查manual就好了, Fortran和MPICH的manual都要查查, double check 正在解决中，再次谢谢您的指导:tiger05:顶一下回复
正在解决中，再次谢谢您的指导:tiger05:顶一下 在我的mac系统下解决
(1) # ./configure --prefix=/YOUR_DESTTINITION_FOLDER --enable-f77 --enable-fc --enable-cxx F77=ifort FC=ifort CC=icc CXX=icc
(2) # make
(3) # make install
然后进入(1) 中指定的mpich的安装目录, 可以看到如下命令:
mpic++, mpicc, mpicxx, mpif77, mpif90
证明了mpich 和 C++, Fortran编译器的耦合
前提: 安装好Intel C++ 和 Intel Fortran Compiler
后续注意: 如果系统中安装多个版本的编译命令, 在使用的时候, 指明其绝对路径, 以免系统自己调用的那个, 不是你想要的.
此贴已解.回复
在我的mac系统下解决
(1) # ./configure --prefix=/YOUR_DESTTINITION_FOLDER --enable-f77 --enable-fc --enable-cxx F77=ifort FC=ifort CC=icc CXX=icc
(2) # make
(3) # make ins ... 太感谢了，我刚刚做好，但是效率不高。原来做过一次并行lammps，是直接从新立德里面安装的openmpi，我当时不知道怎么生成的这些mpif77，mpicc这些东西。直到昨天晚上想把cpmd并行一下，一直无法成功，才发现这些新立德安装的东西是直接指向gfortran与gcc的，而cpmd貌似不能用gfortran编译，我不知道怎么办了（如果可以更改新立德的mpif77的软链接指向ifort或者f77，可能就可以通过了）。接着用mpich2，自己设置了一下。下面是比较并行与串行的结果：
================================================================
BIG MEMORY ALLOCATIONS
----------------------------------------------------------------
PEAK MEMORY
7655183 = 61.2 MBytes
================================================================
****************************************************************
****************************************************************
SUBROUTINE
ELAPSED TIME
----------------------------------------------------------------
TOTAL TIME
****************************************************************
CPU TIME :
0 HOURS 10 MINUTES 42.00 SECONDS
ELAPSED TIME :
0 HOURS 11 MINUTES 45.81 SECONDS
CPMD| SIZE OF THE PROGRAM IS 4 kBYTES ***
PROGRAM CPMD ENDED AT: Mon Nov 29 11:33:57 2010
================================================================
= COMMUNICATION TASKAVERAGE MESSAGE LENGTHNUMBER OF CALLS=
= SEND/RECEIVE
38691. BYTES
= BROADCAST
10919. BYTES
= GLOBAL SUMMATION
9510. BYTES
= GLOBAL MULTIPLICATION
= ALL TO ALL COMM
594281. BYTES
PERFORMANCE
TOTAL TIME=
= SEND/RECEIVE
98.938MB/S
0.188 SEC=
= BROADCAST
198.743MB/S
0.030 SEC=
= GLOBAL SUMMATION
14.973 SEC=
= GLOBAL MULTIPLICATION
0.001 SEC=
= ALL TO ALL COMM
178.818MB/S
50.898 SEC=
= SYNCHRONISATION
0.085 SEC=
================================================================
================================================================
BIG MEMORY ALLOCATIONS
----------------------------------------------------------------
PEAK MEMORY 2.1 MBytes
================================================================
****************************************************************
****************************************************************
SUBROUTINE
ELAPSED TIME
KIN_ENERGY
----------------------------------------------------------------
TOTAL TIME
****************************************************************
CPU TIME :
0 HOURS 12 MINUTES 46.00 SECONDS
ELAPSED TIME :
0 HOURS 13 MINUTES 15.23 SECONDS
CPMD| SIZE OF THE PROGRAM IS 6 kBYTES ***
PROGRAM CPMD ENDED AT: Mon Nov 29 10:29:00 2010
（3）并行只用一个cpu
================================================================
BIG MEMORY ALLOCATIONS
----------------------------------------------------------------
PEAK MEMORY 3.0 MBytes
================================================================
****************************************************************
****************************************************************
SUBROUTINE
ELAPSED TIME
----------------------------------------------------------------
TOTAL TIME
****************************************************************
CPU TIME :
0 HOURS 14 MINUTES 48.00 SECONDS
ELAPSED TIME :
0 HOURS 12 MINUTES 29.39 SECONDS
CPMD| SIZE OF THE PROGRAM IS 6 kBYTES ***
PROGRAM CPMD ENDED AT: Mon Nov 29 11:47:49 2010
AMD Athlon64 X2的cpu，用的是icc与ifort，好像内存的使用率一直不高，并行和串行的差不多，但是cpu的利用率一直都是很高的。这是只能达到这个并行的地步了，还是还有提高的空间，我刚接触linux还很菜，还请专家多多指教。谢谢了。回复
太感谢了，我刚刚做好，但是效率不高。原来做过一次并行lammps，是直接从新立德里面安装的openmpi，我当时不知道怎么生成的这些mpif77，mpicc这些东西。直到昨天晚上想把cpmd并行一下，一直无法成功，才发现这些 ... 首先, 啥叫"新立德", 我看到你回复有好几处, 大概能猜到, 但是想确认一下, 哈哈.
另外, 关于编译器的选择, 这个是很"为难"的事情. 从我自己的经验来讲 (没有benchmark的数据), 大概我估摸出这么几个比较优化的组合:
(1) Quantum-espresso: Intel
(2) Lammps, CPMD: PGI
或者说, 我感觉除了 Quantum-espresso 在intel下速度很满意之外, 其他的都是PGI占优.
当然, 这只是在你自己的cluster上的时候的情况. 一般大型的机器, 一般都有专门经过优化的编译器.
所以我的建议是: 在允许的范围内, 尝试几种编译器. 不管怎样, 能安装起来, 能顺利并行起来是王道, 后面的优化, 是比较tricky的, 而且, 似乎如果"太"专注优化了, 可能会带来比较大的浮点数误差. 我依稀记得有文章(或者书)说过这个, 但是忘记出处了.回复
首先, 啥叫"新立德", 我看到你回复有好几处, 大概能猜到, 但是想确认一下, 哈哈.
另外, 关于编译器的选择, 这个是很"为难"的事情. 从我自己的经验来讲 (没有benchmark的数据), 大概我 ... 哦，呵呵，我刚刚接触linux系统用的是ubuntu，据说比较容易上手，“新立得软件包管理器”有点像windows里面的“控制面板”，如果在“新立得”能找到你所需要的安装代码的话，安装的时候只要选定，点击“应用”就可以安装了，省去了编译的过程，感觉这是ubuntu最方便之处。
啊，不好意思，:tiger36:，还没有cluster，我只是在自己的单机上双核并行实验一下，感谢专家的经验，一定谨记回头有机会一定实验一下这些优化。再次对您详尽的指导表示感谢:tiger28::tiger06:
真的是受益匪浅，学到很多东西。谢谢您。
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Windows7系统下ANSYS_Fluent14.0多机并行安装及启动设置
1. Windows7系统下ANSYS_Fluent14.0多机并行安装;
2. MPI设置细节;
3. 局域网多机共享设置;
4. fluent多机并行启动设置;
Windows7系统下ANSYS_Fluent14.0多机并行安装及启动设置
关于ANSYS_Fluent14.0的多机并行安装及设置，网上没有详细的介绍，有的也是比较早的版本。经过几天的反复摸索，终于完成并行安装及设置，为了避免遗忘，现把安装及设置过程记录下来。
1. 关于多机并行和单机多核并行
单机多核并行，即一台机器多核处理器，进行并行计算，这个大多数都能比较轻松实现，再次不在详述。
多机并行，即多个电脑并行起来，其中一台电脑作为主机，其他电脑为副机，实现多台电脑的计算集群达到并行计算的效果。
2. 安装软件，版本为ANSYS_Fluent14.0（其他版本未测试）
在每台计算机的相同目录下安装ANSYS，如D:\Program Files\ANSYS Inc；具体软件安装过程可以参照网上的教程， 自己搜索下……
其中，第三步也需要安装，即Install MPI for ANSYS Inc,Parallel Processing，其中包括两个MPI版本，分别为Intel MPI和Platform MPI，分别安装即可。
3. 设置共享
Word文档免费下载： （下载1-4页，共4页）
FLUENT 并行设置 FLUENT14.0 的设置并行计算的启动...FLUENT Root Path:设置 FLUENT 安装目录。通常此选项... windows下fluent 并行计... 3页 免费 ansys, ...本文介绍了如何实现该操作的详细设置方法。windows 系统下启动 linux 主机群的 ...首先在 linux 系统下安装好 fluent,包括更改环境变量,操作如下: ANSYS 12.0 ...Win7_windows7_系统安装教程_史上最详细图文教程_启动+分区+驱动安装+激活_...2、重新启动电脑,将光盘放进光驱并设置为光驱优先启动。(一般电脑都是从光驱 ...上述三台计算机都是使用 WINDOWS XP 操作系统。 使用的网络: 主机和副机 A ...2、 启动 MS-DOS 命令提示符,进入 fluent 安装目录输入 rshd -install (中间...详细图解在 windows7-64 位系统中安装 Exceed.13+Gambit2.4.6+Fluent6.3.26 注意:安装前一定要退出所有安全保护软件,并且网络连接正常,新版本不用修改时间日期...ansys, fluent, CFX并行计算设置_能源/化工_工程...(安装后 Fluent6.3 根目录设为共享) 选项说明 ...位Windows 下顺利运行 2 Windows32 位操作系统启动...ansys, fluent, CFX并行... 6页 1下载券 windows下fluent 并行计... 3页...完成上述操作后,请启动RSH服务。 4、资源管理器里面将Fluent的安装目录设置为...Win7 系统笔记本安装64位ANSYS13.0方法 黄同学...分别设置 Pro/E 的安装语言、启动 Pro/E 的命令...To cache your Windows password, open a Command ...[总结]windows下fluent并行_机械/仪表_工程科技_...主要就是在登陆里面输入账号秘密,然后启动就可以了。...但 6.2.16 安装后 fluent6.2.16/ntx86/3d_...网卡是否安装正确,在系统中是否 存在资源冲突。 交换...‘计算机配置-Windows 设置-本地策略-用户权利指派’...FLUENT 并行解算器(包含空格) ,B 机器不需要启动 ...追逐内心的平和}