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蛋白质分形结构及功能研究分析.pdf 79页
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硕士学位论文
蛋白质分形结构及功能研究
姓名：王建平
申请学位级别：硕士
专业：环境科学
指导教师：柴立和
．蛋自矮是生命体的基本组成物质，蛋皇质豹结构决定箕生物功畿。为了充分
认识蛋白质的生物功能，就必须对蛋囱质的结构作进一步的研究。目前，肽链折
叠成蛋白质结构层次的机制尚未认识清楚；而在蛋白质结构预测中，蛋白质二级
结构预测怒一个很值得研究的问题，它是氨基酸一级序列和三级结构之间的桥
梁，二级结构预测为三级结构模型的构建建立了起始点。在过去的二十几年中，
尽管科学家们己经提出了几十种预测蛋白质二级结构的方法，进展仍然十分缓
慢。如果只利用单一序列的信息，迄今为止，预测成功率只有76％左右，这预测
的精度远远不能满足正确推鳜蛋白质分子三维空间结构及功能的要求。
本文的研究分互部分：～是考虑分形维数与蛋白质结构层次的关系，在最大
流原理的基础之上，对肽链折叠成蛋囱质空间结构的机制进行了数理推导，为研
究蛋自质的生物功能和揭示生命的起源提供参考。不同的分形维数体现不同的拓
扑结构，而分形维数又受环境影响因子口的影响，因此提出了环境影响因子a可
以作为区分蛋自质结构的一个标准。二是蛋自震结构之闻存在鸯相毫冀性，将自相
似性很强的自组织映射(SOM)网络用于蛋白质二级结构预测，其结果将二级结构
预测精度提高了三个百分点，这将对蛋白质结构预测起到推动作用。三是蛋自质
的空间结构决定了其生物学功能，而蛋白质的空间结构又受分形维数和环境影响
因子口的制约，因此在预测蛋白质的生物功能时，从分形维数和环境影响因素两
个方面，以生物进化的观点对其进行了阕述，这将对蛋囱质分子瘸发祝制瓣理解
和药物分予设计起指导意义，以使蛋囱质的生物功能朝着人类需求的方向发展。
关键词：结构预测SOM网络最大流原理分形维数环境影响因子a
Asessentialmaterialof
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organism,theproteinplayed
functionsthatale
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structureisnot known
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水稻类整合素蛋白免疫定位及其编码基因克隆与表达.pdf 38页
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张昌轮：水稻类整合素蛋白的免疫定位及其编码基因的克隆与表达
整合素是动物细胞粘附分子的重要成员，属于一类跨膜蛋白的超家族，是由两个跨膜
糖蛋白亚基(a和B亚基)通过非共价键连接而成的异二聚体，介导细胞间的粘附作用和
细胞内外的信号转导，是胞外基质．质膜．细胞骨架连续体的重要组成部分。植物中存在的
芥中编码类整合素基因(ATl4A)具有同源序列的基因，并且预测蛋白结构表明其与动物
和细胞生物学等技术，以判明水稻中是否存在与动物整合素具有类似结构与功能的蛋白
(类整合素)，并克隆OslLP基因获得相应的转基因悬浮细胞系后初步研究其功能。主要
结果如下：
1．通过改善培养基和培养技术建立了野生型水稻(日本晴)悬浮细胞系。实验结果表
明，液体培养基中pH值和生长素(2，4一D)含量对悬浮细胞系的建立和健壮生长影响较
2．以人整合素p1亚基抗体作探针，采用间接免疫荧光定位的方法，分别在水稻根尖细
胞、愈伤细胞和悬浮细胞的细胞膜和细胞核上出现了类整合素蛋白标记的特异性荧光，提
示其很可能也定位于细胞膜。
基因GFP融合构建了过表达载体，再通过原生质体瞬时表达技术研究了OslLP蛋白在细
胞中的表达和定位，结果表明OslLP．GFP融合蛋白主要在质膜中表达。再通过农杆菌介导
的方法侵染水稻悬浮细胞，获得过表达的转基因悬浮细胞系，结果进一步确证了OslLP蛋
白主要定位于细胞膜。同时，转OslLP基因悬浮细胞系的建立也为该蛋白生理功能的研究
创造了条件。
以上结果表明，水稻细胞质膜上存在与动物整合素具有类似结构(或抗原决定簇)的
蛋白——类整合素。其是否与整合素～样作为质膜上的中间分子介导了植物细胞壁．质膜．
细胞骨架连续体，从而参与了细胞内外信号的转导还有待进～步深入研究。
关键词：膜蛋白，类整合素蛋白，悬浮细胞，基因克隆与转化，水稻
扬州大学硕士学位论文4
Ascelladhesionmoleculesin
toah11dtransmembrane
animal．integrins
transmernbranesubunits
areheterodimerswhichconsisttwo
glycoprotein
superfamily．111ey
link non-covalent
(仅andp subunits)andby
bond．Integrinsimportantcomponents
extracellular
continuum，and
matrix(ECM)一plasmamembrane—cytoskeletonthey
betweencellsandcell
transductioninbothdirections．The
attachment
thesimilarstru
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PTP1B为靶位利用RNAi技术治疗糖尿病的初步探究.pdf 113页
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博士学位论文
PTPlB为靶位利用RNAi技术治疗糖尿病的初步研究
生命科学学院
生物化学与分子生物学
指导教师：
黄伟达教授
完成日期：
博士论文：PTPIB为靶位利用RNM技术治疗糖尿病的初步研究
蛋白酪氨酸磷酸酯酶
phosphatase
T一细胞蛋白酪氨酸磷酸酯酶
proteintyrosinephosphatase
LAR 白细胞共同抗原相关蛋白酪氨
Leukocyte antigen-related
酸磷酸酯酶
SHP2 含有SH2结构域的磷酸酯酶2
SH2一domain·containing
P13一K 磷酸肌醇3位羟基激酶
Phosphatidylinositol··3-kinase
Akt．／PKB
ProteinKinaseB
GSK．3 糖原合成酶激酶3
Glucogensynthase
葡萄糖转运蛋白4
transporter
磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶
Phosphoenolpyruvatecarboxykinase
胰岛素样生长因子
Insulin—like
胰岛素样生长因子结合蛋白1 IGF-bindingprotein一1
脂肪酸合成酶
Fattysynthase
核酸内切酶制备的siRNA
Endoribonuclease—prepared
博士论文：PTPlB为靶位利用RNAi技术冶疗糖屎病韵初步研
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