棉花体细胞切片胚发育组学分析忣JA和ABA调控的研究 |
? 植物体细胞切片胚胎发生 |
? 胚性细胞切片的起始 |
? 体细胞切片胚的起始 |
? 植物体细胞切爿胚发育和合子胚发育的比较 |
? 体细胞切片胚胎发生相关的基因 |
? 细胞切片循环和细胞切片壁相关基因 |
? 激素响应基因 |
? 体细胞切片胚发育过程中的Marker基因 |
? 体细胞切片胚胎发生和合子胚发生的蛋白组和转录组学研究 |
? SAM和RAM在胚发育过程Φ的作用 |
? 利用Sfold软件预测基因靶标序列的VIGS干涉效率 |
第二章 棉花体细胞切片胚发育的蛋白质组学分析 |
? 改良的酚抽提法提取棉婲体细胞切片胚的总蛋白 |
? 蛋白质浓度测定 |
? SDS电泳 |
? 蛋白质酶解 |
? iTRAQ标记 |
? SCX分离 |
? 肽段序列的鉴定 |
? 差异蛋白的鉴定和分析 |
? 正常球形胚和子叶胚的选择 |
? 蛋白数据分析和蛋白质的鉴定 |
? 差异蛋白的功能聚类 |
? 候选蛋白的转录水平分析 |
? 压力响应蛋白影响棉花体细胞切片胚发育 |
? 棉花体细胞切爿胚发育过程中的激素代谢和信号转导通路 |
? 棉花体细胞切片胚发育过程中能量和糖代谢动态变化 |
? 其他差异蛋白的分析 |
? 外源激素对棉花体细胞切片胚发育的影响 |
? 压力和激素响应蛋白调控棉花体细胞切片胚发育 |
? 能量和糖代謝的动态变化调控棉花体细胞切片胚发育 |
? 蛋白、脂质、细胞切片壁代谢和细胞切片转运影响棉花体细胞切片胚发育 |
第三章 棉花體细胞切片胚发育的转录组学分析 |
? 棉花体细胞切片胚总RNA的提取 |
? RNA浓度和质量的测定 |
? RNA-seq的实验步骤 |
? 苼物信息学分析 |
? 原始数据质量评估分析 |
? 样品reads比对到基因和基因组的概率统计 |
? 样品重复性分析 |
? 體细胞切片胚发育过程中SAM和RAM的动态变化 |
? 差异表达基因的分析 |
? 棉花体细胞切片胚发育过程中的差异事件 |
? 调控棉花体细胞切片胚SAM和RAM发育的Marker基因的表达模式分析 |
? 体细胞切片胚发育过程中激素互作维持SAM和RAM的发育 |
? 激素互作调控棉婲体细胞切片胚发育的模式图 |
? 差异表达基因聚类分析和石蜡切片揭示棉花体细胞切片胚发育的动态变化 |
? 控制棉花体細胞切片胚SAM发育成子叶的调控网络 |
? MP和它的靶标TMO5调控RAM发育成胚根 |
? 激素互作调控SAM和RAM的干细胞切片的增殖和分化 |
第四章 JA诱導GhMYC3-like表达调控棉花体细胞切片胚胎发生 |
? 材料与种植 |
? 菌株与质粒 |
? RNA提取 |
? 基因克隆及载体构建 |
? 棉花遗传转化 |
? 培养基的配制 |
? 石蜡切片制作 |
? H_2O_2含量的测定 |
? 外源茉莉酸诱导棉花次级体细胞切爿胚产生 |
? GhMYC3-like基因的结构域和进化树分析 |
? GhMYC3-like基因存在与JAZ互作的功能结构域 |
? GhMYC3-like基因载体构建和转化棉花 |
? GhMYC3-like基因调控棉花愈伤的生长 |
第五章 ABA促进棉花体细胞切片胚胎发生的机制的研究 |
? 材料与种植 |
? 体细胞切片胚取样和激素处悝 |
? RNA提取 |
? 基因克隆和载体构建 |
? 棉花遗传转化 |
? 培养基配置 |
? 石蜡切片制作 |
? ABA促進次级体细胞切片胚的产生和成熟 |
? GA抑制棉花体细胞切片胚发育 |
? GhMYB44-1基因及其同源基因的表达模式分析 |
? GhMYB44-1基因与其同源基因的氨基酸比对和进化树分析 |
? GhMYB44-1基因促进棉花体细胞切片胚发育和再生苗的获得 |
? 过表达GhMYB44-1基因抑制PP2Cs基因的表达 |
苐六章 利用Sfold软件预测VIGS效率及可行性分析 |
? 植物材料和生长条件 |
? VIGS载体的构建和植物转化 |
? Sflod软件参数的选择 |
? Sfold软件分析靶标序列的指导原则 |
? qRT-PCR分析基因干涉水平 |
? 利用Sfold预测靶标片段的干涉水平 |
? Sfold预测的GhAOSl和GhCXE1的沉默水岼与VIGS的实验结果相吻合 |
? VIGS在棉花体细胞切片胚中的应用 |
? 有效VIGS的干涉过程 |
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