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最近开始涉及蛋白质谱技术遇到一些问题向大家请教。有一种人的免疫球蛋白通过X线衍射技术已經知道其FAB段轻链和重链的氨基酸序列。我想看看病人血中是否存在这种抗体因此,我取病人血清跑胶后取相应条带打质谱现在遇到的問题是,打完质谱发现捕获一条肽段序列显示是Unique, pep score=30.38, pep
expect=0.0049。但是我拿这个肽段序列放在uniprot中blast能够检索到该序列和有一个蛋白的某段序列完全相同,但该蛋白在uniprot中是unreviewed我还能认为我打质谱时捕获的肽段序列是UNIQUE的么?我能认为该患者血清中有该抗体么求大牛指点!
(备注,在打质谱時是人为把该免疫球蛋白的氨基酸序列和uniprot数据库合并进行检索的。 )
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