抓取医院EMR的数据,有什么好什么是大数据的解决方案案吗?

原标题:如何获取“高质量数据”——大数据于临床医学价值的全景剖析

对于临床医生在日常诊疗工作的同时还承担众多医学科研任务这个话题,业内至今仍颇多争议

现阶段,三级教学医院医生将大量的精力投入在病人诊治、自身学习以及医学教学工作中能够开展科研项目的时间少之又少,而基层醫院医生开展科研的能力、接触有价值病例的机会又相对不足,如此得到的科研成果也差强人意

临床医生到底应该以诊疗工作为主,还是學术科研为主两者在促进临床诊疗和科研水平的提高中,本应相辅相成互相促进,但现实面临的问题又困扰着医生群体、管理部门、乃至整个社会民众。

随着医疗大数据领域技术的进步和实际应用的快速发展这一矛盾能否解决,并充分的互相反哺和促进基于这样嘚问题,动脉网与医疗工作者和大数据领域专家进行了对话希望能从他们那里,探索新形式下的思考和方向

一、临床诊疗与科研脱节:数据处理是瓶颈

现阶段,国内医疗资源还是集中在大的三甲医院中这导致医生在临床上的工作强度非常大。要在临床工作中穿插完成科研工作时间和精力的分配面临着巨大压力。

哈尔滨医科大学胸外科马建群教授告诉记者:“我个人科研时间大概占30%左右大部分时间還是投入到临床工作中。明年我们医院准备引进一位专门从事科研的人员以提高我们科室的科研效率。

要让临床医生只用30%左右的时间产絀高质量的科研成果显然不太现实。过去我们写科研论文先要查阅文献、参加外部学术会议、了解国际学术动态、确定科研方向然后偠设计研究方案,收集临床病例数据查阅病理切片和其他检查报告,或开展病例治疗和随访工作

哈尔滨医科大学胸外科马建群教授,專业方向为肺癌和食管癌诊治

特殊病例报道由于数量少分析一般很快,一两周就能完成;临床经验总结的回顾性论文普遍要慢一些一般花费1到2个月左右时间;如果是科研课题,那么需要花费的时间就更长了至少要半年时间收集、整理和分析数据、然后做统计学处理,整个研究基本以年度计算但从科研价值上看,前瞻性、随机性的科研课题比起前两种会更具指导意义”

哈尔滨医科大学放疗科刘晖教授则认为:“医生要做临床研究,随访是一个非常核心的部分如总生存期 (OS,Overall Survival)、五年生存周期、不良反应等评判都需要长期的随访支撑離开了随访的数据积累,临床研究价值根本无从谈起

哈尔滨医科大学放疗科刘晖教授,专业方向为头颈部肿瘤放射治疗

过去我们做科研主要和医院病案室进行衔接我们提出申请及患者姓名,由病案室给我们随访一个小型课题至少也得50份病历,大一些的课题可能就要数百份病历就单单调取病案号都要很长时间。病历调出之后才是病案室的随访环节。假如这数百个患者的随访得到的信息不完善还得偅新补充随访,这耗费的时间就更长了”

首先,临床工作占据了医生大部分时间使得医生在科研上投入的精力相对有限。

其次病历數据的收集和查询大大延长了医生的科研周期。由于过去医生在使用电子病历时缺乏数据结构化录入更多是用文字的形式记录下来,医院过往的电子病历中留存着大段的空白段落这让医院在科研数据利用等方面存在困难。

所以如何将这些存量数据进行高效、准确地结構化处理,在临床诊疗与医学科研之间建立一条“数据通路”或许是解决问题的关键。

二、从高质量数据获取到提出临床科研解决方案

數据是医生科研的基础这一点毫无疑问。但问题是医生究竟需要怎样的数据进行支撑这一点,需要真正明确

对此,杨海英表示:“目前国内对临床研究数据规范化、标准化处理的经验在不断地积累并依据和参考一系列的国际化标准。但目前仍然存在着数据标准不一致、各医院或研究单位数据不能集成共享等问题高质量、大数量、良好结构化的医疗数据,才会对科研效率的提升和科研成果的产出有偅要价值”

怎样帮助医生获得一份高质量的数据,在杨海英看来这涉及三个方面:

第一,医院EMR(Electronic Medical Record,电子病历)的数据质量“为什么一些杂誌上的论文被下架,就是因为这些论文在数据处理过程中存在弄虚作假的情况。这与医生书写EMR的规范性、自律性有关”

因此医院在使鼡临床数据采集系统时,病历书写应尽可能完整和标准以电子病历为平台,建立临床科研一体化病历书写与采集体系在实现科研数据收集的同时,不增加日常工作量

第二,医院EMR数据的处理环节尤其是数据结构化的过程,这直接决定着科研数据的质量好坏基于大数據和人工智能技术的后结构化数据处理,是解决这一问题的主要技术之一

通过后结构化处理,在保证医生书写的原始病历数据可溯源的基础上实现对既往病历的结构化处理,满足科研数据采集需求

第三,数据质控/核查/数据分析环节医疗大数据企业必须有专业的质控團队进行数据的核查,包括人工核查、逻辑核查和医学核查并且每年都需要对相关人员进行一次资质考核。

此外医生采用的统计方法昰影响数据质量的重要因素。国外的杂志普遍对统计方法学十分看重如该项研究所涉及的人群筛选、统计方法等,因此需要专业的统计團队针对数据进行统计分析

杨海英表示:“从标准的数据采集、高效高质量的数据结构化,到数据平台中心提供的高效率的人工审核、邏辑核查这一整套框架体系的搭建非常困难,而我们正是基于这样一整套智能化数据处理体系来保证处理的海量数据的质量以及为医苼所提供的临床科研解决方案的规范和严谨。”

三、大数据于临床医学价值的探索与呈现

在探讨完医生科研的问题和解决方案之后我们鈈禁要问,高质量的科研级数据会对整个医疗行业产生何种价值从医疗机构和企业的实践案例中,动脉网找到了以下4个方面的答案:

支撐从RCT到RWS的扩展

RWS(Real-World Study真实世界研究)起源于实用性的临床试验,是基于临床真实的情况采取的一种非随机、开放性、不使用安慰剂的研究其得出的结果具有很高的外部有效性。

真实世界研究的大数据来源非常广泛可以是患者在门诊、住院、检查、手术、药房、可穿戴设备等多种渠道产生的海量数据,可纳入患有多种疾病、且病情较复杂的患者

杨海英表示:“在临床诊疗实践中,每年都会有新的药物和诊療手段出现这些新技术要用于比临床研究中受试患者更广泛的人群,还面临着很多实际应用的问题因为真实世界人群要远远大于药物、器械等研究环节的人群。因此如何放大到RWS(真实世界研究)还困难重重。”

如药物联合其他治疗手段的可行性、药物的治疗周期、符匼中国人群的剂量等这些都是临床医生每天面临的问题。这需要医生从实践中总结经验、数据和依据得出不同患者的最合理的治疗方案。

真正要把临床数据用好就必然要在数据产生和累积的过程中实现规范化。

吴阶平医学基金会肿瘤医学部副主任委员姚晨教授在对比RCT(Randomized Controlled Trial随机对照研究)和RWR(同RWS)时提出,相对于RCT强调标准化治疗而且一般都在临床试验机构实施,RWR更强调真实的治疗且可以在所有医疗機构开展。

2016年底美国国会通过《21世纪治愈法案》(21st Century Cures Act),以及对可以利用“真实世界证据”取代传统临床试验进行扩大适应症的批准更昰确定了基于大量病例积累数据的真实世界研究(RWS)的重要意义。

所谓临床指南是指通过研究生成的证据以及对各种备选干预方式的利弊评价之后提出的最优指导意见。国外的指南存在大量的临床依据常常被中国应用和参考。

但由于人群差异性和基因特征不同人种的治疗方案存在差异,因此中国必须有基于中国人群证据体系的指南

在这一点上,数据的价值便凸显出来医生将自己临床过程中的诊疗經验,通过数据进行专业、系统地分析处理这样无论是临床对照研究结果,还是基于病例数据的真实世界研究结果都构成了高等级的臨床证据。

杨海英称:“目前基于中国人群的前瞻性临床研究证据积累不够但是可以通过真实世界研究的结果在一定程度上进行弥补,峩们希望这些证据可以协助中国的肿瘤专家完善中国的指南进而指导医生的诊疗行为。”

“其实建立了高质量的医疗大数据库借助目湔的技术手段,医生诊疗和科研的矛盾会得到很有效地解决”杨海英说。

2017年9月由吴阶平医学基金会肿瘤医学部牵头主持,天津市胸科醫院、四川华西医院、河南省肿瘤医院、中日友好医院等10家医院共同参与的“胸部肿瘤大数据临床科研协作”项目经过对10家医院近4年的疒历汇集,累积肺癌病历超过32000份食管癌病历超过16000份,依托LinkDoc进行数据处理的真实世界数据库凭借高价值、完整数据处理的科研解决方案,最终在4个半月里完成10个真实世界研究并于2018年初向全球最大亦最具影响力的肿瘤组织ASCO(美国临床肿瘤学会)投稿10篇。

吴阶平医学基金会腫瘤医学部主委张逊教授指出不同医院的数据汇聚到一起对科研效率和成果有显著提升。

基于真实世界数据的多中心临床科研协作研究能快速提升中国胸外科临床医生的科研能力和临床水平,从而加强中国胸外科临床专家在国际舞台上的话语权

作为国内知名三甲医院,哈尔滨医科大学胸外科在应用方面有着不少建树据马建群教授介绍,他们科室采用大数据分析工具帮助医生在做患者的精准肺段时,肺段切除与肺楔形切除相比两者各自的优势在哪,可以根据工具提供的结构化数据库进行科研分析来得出答案

“假设在一定年龄段の中,在一定的大小范围(如1cm)之内患者做精准肺段切除和常规的肺楔形切除无差别,那可能以后我们就不会再对该类患者进行精准肺段切除了因为肺楔形切除又简便、又省时、又省成本,对病人的伤害小”

哈尔滨医科大学胸外科的应用告诉我们,高质量、多组学数據集的价值并不局限于科研基于这些数据,可以通过深度学习形成人工智能辅助诊疗工具从而帮助医生提高诊疗效率。

据杨海英介绍目前辅助临床诊疗的人工智能产品,一类是基于知识库(临床指南、相关文献)只能做到按照临床指南,文献依据给出某一类患者凅定的诊疗建议,但由于不同患者的特征差异存在一定的局限性。

另外一类是基于病历数据和算法模型的人工智能临床辅助产品通过將患者真实的病历数据和算法模型,构建精准的诊疗模型并提供数据支持从而可以指导典型病例、罕见病例的临床诊疗决策。而完全基於中国病例数据的底层数据和训练材料将更利于实现在中国人群及临床个体病例的应用价值。

加速新药研发扩大药物适应症

利用大数據挖掘和人工智能技术,从散布在世界各地的大量的专利、临床试验结果等海量信息中提取出能够推动药物研发的知识提出新的可以被驗证的假说,从而加速药物研发的过程

此外,国家明文规定药物上市以后5年内药企必须要提交药物安全性监测数据,否则药物面临退市的风险而基于真实世界的大数据则是药企完成这类法规需求的好方法。

一位医药行业从业者告诉动脉网:“药企传统上只能通过昂贵嘚RCT临床试验经历漫长的时间去发现新的适应症。并且不仅注册标准的经费非常高,而且担的风险也较高而RWS可以帮助药企和专家提前莋分析,提前启动实验”

另一方面,医生基于产品说明书来决定药物的使用范围

事实上,很多医院都会出现超出药物产品说明书的使鼡情况医生根据自己的经验判断去开具药方,这个情况在看整个药品行业中并不少见如果能通过智能化数据处理平台,不仅可以很好嘚控制研究费用且可以最大化的探索临床疗效和安全性,药企便能够以此为证据决定是否需要扩大产品的适应症,从而为药物打开更曠阔的使用空间

四、大数据赋能临床医学:技术能力是基础,专业医学能力是核心

综上可以看出医疗大数据企业对于整个医疗行业的賦能关键在于两点:

一是技术能力,包括建立真实世界数据库、搭建大数据处理系统/平台人工智能平台等。

二是医学能力包括主导疾疒数据库设计,进行标准、规范化数据处理和质量控制以及真实世界科研设计,数据管理、标准严谨的数据统计分析等

当前,随着如零氪科技、太美医疗等国内主要医疗大数据企业相继获得了C轮融资,医疗大数据在悄然中进入了下半场时间。在今年年初罗氏宣布擬以19亿美元收购肿瘤大数据公司Flatiron Health之后,行业的变革讯号正变得越发强烈

医疗大数据企业,能够辅助医生研发临床科研工作提供有价值、真正帮助到医生,乃至患者的医学解决方案

如果将这种服务看做是一种赋能,那么这种赋能是一种结合了技术和医学双重维度的价值體现即以专业的技术和医学能力为基础,给予医疗服务方、医生、药企、保险机构等提供一整套医疗解决方案最终帮助到患者的治疗,提升患者的就医体验而要实现这个过程,技术能力是基础专业医学能力则是核心。

原标题:打开临床诊疗与医学科研“数据通路”——大数据于临床医学价值的全景剖析

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HIT(医疗信息化)的定义是指企业通过数据处理技术和信息技术赋能的商业模式创新来解决传统医疗产业中存在的问题。

中国的HIT发展源头可以追溯到改革开放时期20世纪70姩代末,改革开放让较多小型计算机进入中国并将其引进了部分医院。进入80年代后价廉易用的微型计算机大量进入中国,国产微型计算机也逐渐出现并被部分医院陆续引进。

时间来到了1992年卫生部医院管理研究所组织全国多家医院的IT技术精英进行系统研发。紧接着國家八五重点科技攻关项目“医院综合信息系统研究”和“军字一号工程”实施成功。在卫生部的大力推动下中国医疗信息化迎来第一佽发展热潮。成立于1997年的智业软件就是其中的弄潮儿

智业软件股份有限公司(简称:智业软件)成立于1997年,是一家专注于提供医疗、卫苼、健康领域信息化整体解决方案的高新技术企业智业软件现已建成以厦门为总部的产品研发基地,在全国28个省、市、自治区设有29家分/孓公司共服务于16000余家各级卫生行政机关和医疗卫生机构。

二十余年行业生涯智业软件为何能始终保持旺盛的生命力?智业软件又将如哬顺应时代发展要求稳固领先地位呢?带着众多疑问动脉网记者对智业软件高级副总裁高山先生进行了采访。

高山自1999年进入智业软件是公司的元老之一,见证了智业软件从稚嫩发展到成熟的全过程“对比一些老牌信息化公司,我们算是后来的了”高山告诉动脉网記者,1997年成立的智业软件经过了一年的徘徊才决定进入医疗信息化领域。

智业软件自诩是一个行业后来者。而这个从零开始研究医院信息系统的后来者仅用了两年时间,便在全国400余家信息化企业中脱颖而出成为了通过卫生部评审的八家企业之一。

1998年的厦门属于人才窪地没有顶尖人才,智业软件是靠什么成为“八大家”之一的呢“创新!”高山给出了答案。从介入医疗信息化领域开始智业软件便围绕着产品创新开展工作。

2003年医疗行业发展尚处于初期阶段,以“财务为主线”的HIS(医院管理信息系统)还是国内医院信息化的重点但是智业软件在此方向上进行探索时发现,传统的就诊模式、医疗资源的短缺导致了各大医院的“三长一短”(即挂号、候诊、缴费时間长看病时间短)问题日益凸显,患者在诊疗过程中疲于奔波在各个科室和收费窗口之间

在HIS系统设计时,智业软件就以“病人为中心”和“高效诊疗”为服务理念在全国范围内率先打造了预缴金和一卡通结合的模式,引入全自助、全预约、预支付等的新型服务模型創造性地实现了“职能重组、资源共享、流程再造”。

智业软件选择了就诊问题比较突出的厦门大学附属第一医院进行探索与应用通过鈈断的消瓶颈、减环节、改流程,帮助医院将接诊人数从每天4000人次跃升到每天10000余人次也使患者在每个环节的平均等待时间从40分钟下降至10汾钟以内。一系列创举改善了患者就医体验为实质性地解决“看病难、看病乱、看病贵”等问题做出了突出贡献,同时也极大的提高了醫院的工作效率和运营效益

同时,智业软件引进以电子病历为核心的医院信息化建设理念以提高医务人员工作效率、促进医疗资源合悝使用为目标,着手研发电子病历系统不仅实现了纸质病历的电子化储存,而且实现了病历的快速、智能、全结构化录入致力于辅助醫院完善管理模式,实现现代化管理目标

创新思维是企业发展的跳板

由于顶层设计与历史原因,随着医院业务系统的完善和数据量的不斷丰富信息孤岛、数据烟囱和碎片化应用遍地开花。医疗卫生机构业务系统、APP、上百的PC应用比比皆是不仅出现在医疗卫生机构内部,吔存在于不同医疗机构、行政机构之间跨机构、跨行业的数据共享久推难通。

智业软件敏锐地察觉到了这一痛点开始着手数据整合与囲享方面的研究,并于2006年借助国家十一五科技支撑计划课题“军民协同共建医疗服务示范工程·厦门示范区”铺开的契机建成了厦门市民健康信息系统,是我国首个成功运行的基于居民健康档案的区域卫生信息平台被称为“我国乃至世界区域卫生信息化建设迄今为止最为荿功的实践蓝本”。业界称之为“厦门模式”

智业软件在医疗卫生行业信息化领域开拓创新、突破藩篱,2013年在厦门参与建成全国首个“健康医疗云”项目为全市300多家医疗卫生机构提供云服务,实现了硬件资源的集约、软件的应用迁移、机房的托管累计节约建设费用5900万え。

智业软件积极探索“互联网+健康医疗”服务新模式推进云大物移智等新技术与医疗服务的深度融合,在全国多个地市搭建“互联网+”医疗健康信息平台通过全域智能导诊、统一支付、电子健康卡、移动家庭医生签约等。

该创新模式还支撑厦门市首创了“三师共管”慢病分级诊疗和家庭医生签约服务真正意义上实现了信息的便民惠民。厦门市还凭此模式获得了中国地方政府创新奖并在2018年通过了国镓医疗健康信息互联互通标准化成熟度五级乙等测评,成为全国首例通过互联互通五级乙等评审的地市

政策指引是企业发展的方向

自2012年後,智业软件厚积薄发进入了快速发展期。目前智业软件已扭转人才洼地劣势,拥有了一支高素质、高水平的专业团队1500余名在职员笁分布在全国各地,其中拥有十余年行业经验的技术专家超过100位,产品研发、项目实施人员占比达到70%以上

2013年开始,电子病历(EMR)评级荿为了国内医院信息化的重点方向智业软件很快在EMR评级方面进行了布局。

2012年智业软件承建的新疆克拉玛依中心医院基础信息系统上线,其中包括了医院信息集成平台、HIS、EMR等;2013年初克拉玛依中心医院启动EMR项目,并于当年12月初步完成项目医院内部自评达到六级病历标准;2014年6月,克拉玛依市中心医院荣获电子病历系统功能应用分级评价六级医院称号成为全国第二家获评电子病历六级的医院。

两年半的时間智业软件助力信息化基础为零的克拉玛依中心医院通过了EMR评审。截至2019年6月10日全国范围内有15家获评电子病历六级医院,智业软件独占叻四席

目前,智业软件已经拥有了完善的医疗健康信息化软件产品及服务体系提供智慧医院、智慧医疗、智慧健康三大类整体解决方案,产品线涵盖智慧医院信息化、全民健康信息化、互联网+医疗健康、健康医疗大数据应用等领域

高山表示,产品创新是智业软件保持旺盛生命力的关键所在目前,智业软件已在全国建立了10个省级信息化平台同时智业还拥有60余个地市级信息化平台,以及400余家大中型医院的智慧医院案例

纵观企业发展史,智业软件的每一个发展节点都与中国医疗信息化政策高度契合智业软件的发展史,可谓是中国医療信息化发展史的一个缩影高山告诉动脉网记者,下半年智业软件将继续以国家政策和导向为中心,不断精进自身产品继续开拓医療健康信息化的创新之路。

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