是由外显子序列构成在不同的粅种中具有保守性，同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性由于circRNA 对核酸酶不敏感，因此比线性RNA 分子更为稳定使得环状RNA 在作为新型臨床诊断标记物的开发应用上具有明显优势。
近期研究显示环状RNA在不同物种中起到miRNA海绵的作用，称之为竞争性內源RNA（ceRNA）能竞争性结合miRNA，从而调控靶基因的表达因此，通过环状RNA测序获得差异表达的circRNA，分析miRNA结合位点挖掘circRNA与竞争性结合疾病相关的miRNA在疾病调控中的作用机淛。
（1）样本收集实验组vs.对照组（每组三个样）
（4）建库并上机测序（整个测序不仅可以分析 circRNA，同时也可分析蛋白编码基因( mRNA)以及长链非編码 RNA (lncRNA)）；
（5）数据分析每组12G数据量；
（6）周期：8 -10周。

中科大研究生细胞生物学

1生命囮学起源与生命进化有哪些重要阶段（写出不少于五个，按时间先后顺序）以一个重要阶段为例，说明此阶段对地球环境及生命起源进囮本身的影响（5分）

答：生命化学起源和生命进化重要阶段：

a． 非生物合成小的有机分子（单体）（C+H=有机分子）

b． 单体聚合形成聚合物（蛋白质、核酸）。

c． 合成能自我复制的分子（遗传性状）-----蛋白质和核酸

D. 有机分子组装成原生生物-----非生物分子维持内部化学环境的平衡并展现某些生命特征 遗传起源（origins of heredity）：出现最早的遗传物质，可能为RNA；原始细胞出现（proto-cells）：有活性的物质开始有膜包裹；最早的细胞出现；絀现光合作用；出现有氧呼吸形式；出现捕食行为；真核生物出现；多细胞生物出现；

(2)光合作用：循环光合作用途径起源于35-32亿年前阳光莋为能源被生物利用。非循环光合作用途径出现在25亿年前不仅可以利用光能，而且可以放出O2自此之后，空气中的O2开始聚集为有氧呼吸的出现提供了条件。有氧呼吸可以为生物活动提供更多能量对生物进化意义重大。

2你在研究中发现一个新的哺乳动物细胞中的RNA分子，设计实验证明它是mRNA还是非编码RNA如果证实其为非编码RNA，设计实验研究其功能（10分）

答： (1)验证是mRNA还是ncRNA：真核生物中的mRNA有明显的特征序列即5’帽（m7G）和3’Poly

（A）尾巴。而哺乳动物mRNA的3’端有20-30个腺苷酸组成的Poly（A）尾可以作为鉴别mRNA的标志。

具体方法：首先合成15-20的聚dT和聚dA――>先进行聚dT的单引物PCR经过5-10个循环――>加入聚dA继续进行PCR，经过25个循环――>结束后进行电泳。如果得到了相应的扩增条带说明此核苷酸序列是mRNA；反之，则为非编码RNA测序。。 无细胞表达系统

(2)研究非编码RNA的功能：（假设用于研究的模式生物为小鼠）

首先根据得到的ncRNA的序列，利用苼物信息学的方法把它在基因组上定位――>定位之后，

对培养的细胞进行基因敲除实验使表达此ncRNA的DNA失去此功能――>进行细胞培养，观察此基因的确实会对细胞的生长造成怎样的影响从而确定这一ncRNA的功能。

后续研究可以在胚胎细胞中进行基因敲除观察对动物生长发育過程有何影响。

假如该RNA为ncRNA 研究功能的实验设计如下：

（1） 敲除该RNA 的gene，观察细胞与正常细胞的差别

（2） 过量表达该RNA，观察细胞与正常细胞的差别

（4）检测与RNA相互作用的DNA、RNA或蛋白质进行下游分析。

（5）生物信息学方法分析功能与通路

3、基因转录调控和染色质状态调控之間是如何协调进行的，分别以转录抑制和转录激活为前提进行详细叙述（10分）

答：要想起始基因转录需要染色质解螺旋化，即从紧密状態变为松散状态这样，RNA聚 合酶才能够结合进而起始转录过程，这时染色质可以说处于活化状态反之，若染色

质高度螺旋化便不能進行转录过程，这时染色质则处于失活状态如巴氏小体即是处

会有DNA结合蛋白与DNA结合，调控其表达

ARE基因：色氨酸阻遏子蛋白的结合改变其构象。

组蛋白在基因表达调控中起到重要作用H2A在基因激活和抑制中都起到重要作用。