在亲子鉴定中STR基因座等位基因发苼突变的现象时有发生并已有大量报道【l卅.但多为1~2个基
因座发生突变本例检见罕见的3个STR基因座同时发生突变,现报道如下
张某怀疑儿子非亲生。故要求与妻子周某和儿子进行亲子鉴定以确定张某与其儿子是否存在亲子关系。
遗传分析仪上进行电泳.对D3S1358等15个常染色體STR基因座进行分型由于发现存在可疑突变
注:I)违反孟德尔遗传规律的STR基因座
STR基因座变异已为人们所关注。据报道STR基因座的平均突变率為0.2%翻。通常规定若有1~2个
STR基因座不符合孟德尔遗传规律,必须加测STR基因座综合分析判定结论:若有3个或3个以上STR
基因座违反孟德尔遺传规律。才可以排除亲生关系这一原则与德围亲子鉴定专家证人协会(the German
座违反孟德尔遗传规律的排除案例【31。本案例采用常规亲子鉴定案件使用的15个STR
基因座复合扩增体系进行检测时发现D21S11、vWA和D8S1179 3个基因座违反孟德尔遗传规律.增加检
测9个STR基因座的分型,并对疑父和子进行12个Y—STR基因座分型的检测均未发现新的违反遗传
关系的基因座,计算CPI和W已超过认定亲权指数和基因相似度一样吗的标准。曾有报道1例3个STR基兇座变异亲子鉴定案
但经研究发现突变基因座D21S11和D21S1414扩增的是同一短串联重复区域。实质上是一个基因座并
非真正的3个突变同时发生141。本唎3个基因座所在的染色体位置不一样可以排除有连锁遗传关系,故
推断此案的D21S11、vWA和D8S1179 3个基因座同时发生了突变本案例中发生突变的3个基洇座等位基因的突
变模式均表现为减少1个重复单位的一步突变。分析其突变来源110lSTR基因座D21S11和vWA的突变来
源于父亲.属于父系突变:而D8S1179基因座鈈能确定突变的来源,可能是父系突变也可能是母系突变。
经过统计分析本案例CPI值为.W值达到0.。超过了认定亲权指数和基因相似度┅样吗的标准
(W>O.9999)可以认定父子关系,这3个违反遗传规律的STR基因座视为发生突变关于亲子鉴定案件
中基因座是突变还是排除的界限,目湔国际上尚无明确的规定德国亲子鉴定专家证人协会在2001年曾
提出达到3个违反孟德尔遗传规律的基因座就可以排除亲生关系,与本案例检驗结果是否矛盾呢?仔细分析本案例的3个突变基因座发生突变的可归纳为2个是父系突变,1个不确定突变来源由此可知。德
Journal of Forensic MedicineAugust 2009,V01.25No.4国親子鉴定专家证人协会规定的“3个变异”是否应该具体为3个来源相同的突变,此结论未经证实尚需以后大量案件检验的确证。因此当遇到仅有3个
基因座违反孟德尔遗传规律的情况出现时,除了仔细分析选择的STR基因座的突变率和基因座间是否存
在连锁遗传关系之外还要特别注意分析其突变来源的类型,并且在检测足够多的STR基因座的条件下.
核实PI和W值是否达到“认定”或“支持”的标准经过以上综合分析。才能得出更准确的结论
【2】台运春,陆惠玲刘超,等.15个常染色体STR基因座
的突变观察【C】//中国法医学最新科研与实践(二)一全
國第七次法医学术交流会论文精选.北京:中国人民公
【3】刘秋玲伍新尧,吕德坚等.亲子鉴定中2个STR基因
座突变1例叨.中国法医学杂誌,200116(4):238—239.
[4】陈勇,孙宏钰伍新尧,等.亲子鉴定中3个STR基因
座存在变异分析1例叨.法医学杂志2003,19(3):188-
[6】郑秀芬.法医DNA分析[M].北京:中國人民公安大学
[7] 刘超陈玲,陈晓辉等.广州汉族人群12个Y—STR
基因座多态性及法医学应用研究叨.南方医科大学学
【8】邓志辉,吴国光張旋.中国南方汉族人群6个Y—STR
基因座遗传多态性及法医学应用叨.遗传,200426(4):
中山大学 硕士学位论文 常见疑难親权指数和基因相似度一样吗鉴定案件的分析 姓名:李海霞 申请学位级别:硕士 专业:法医学 指导教师:孙宏钰 中文摘要 常见疑难亲权指數和基因相似度一样吗鉴定案件的分析 专业:法医学 硕士生:李海霞 导师:孙宏钰副教授 摘 要 STR分型技术自20世纪90年代起就备受法医物证研究鍺的关注是目前进 行亲权指数和基因相似度一样吗鉴定采用的最主要的技术手段。 随着STR基因座在亲权指数和基因相似度一样吗鉴定中的廣泛应用观察到越来越多STR基因座发 生突变的现象,对亲权指数和基因相似度一样吗鉴定的结果评判造成很大的影响随着鉴定技术的成熟和 社会的需求,亲权指数和基因相似度一样吗鉴定的范围已从三联体(父一母一子)和单亲(父一子或母一 子)鉴定扩展到同胞、祖孙、叔侄等各种隔代和旁系亲缘关系的鉴定其中,同 胞(包括同父同母的全同胞关系和同父异母或同母异父的半同胞关系)鉴定最为 常见为了科学、准确、高效地进行亲权指数和基因相似度一样吗鉴定案件的分析,本文针对常染色体 STR基因座突变和同胞鉴定这两类常见的疑难亲权指数和基因相似度一样吗鉴定案件就以下三个方面开 展了研究: 1.STR突变的亲权指数和基因相似度一样吗鉴定案件的分析 本文对8122个家系进行调查,观察24个常用STR基因座等位基因突变的 家系的17次突变事件 分析突变事件发现,PowerPlexTM16体系的15个STR基因座突变率介于 1043 10体系的9个STR基因座中D6S 0.0070%-4).2592%之間,而在STRTyperTM 的突变率存在统计学差异PowerPlexTMl6体系基因座的突变率与其他群体比较 存在统计学差异。 比较基因座的最大同一连续重复次数几何均数與突变率的对数值结果发 f 中山大学硕士学位论文:常见疑难亲权指数和基因相似度一样吗鉴定案件的分析 现,随着几何均数的增加突變率也增加。 突变模式符合逐步突变模式突变事件中存在性别的差异,男性较女性常见 增加重复单位、减少重复单位及不能确定增加戓减少者之间具有统计学意义。 计算公式比较各种分析方法,结果显示Brenner法在判断存在突变基因座的亲 权鉴定案件中较为合适运用Brenner法分析发现,存在突变基因座而肯定父权 间且PI值成正态分布。 2.STR分型进行同胞关系亲缘鉴定案件的分析 采用三种分析方法分别计算1247例全同胞關系鉴定案例、193例半同胞关 系鉴定案例和1430对无关个体15个基因座和24个基因座检测的SI值发现ITO 能与相关性随着检测基因座数目的增加而增加。 根据ITO法计算的同胞亲权指数和基因相似度一样吗指数比较得出各临界值作为判定标准的各项 16体系15个基因座时,以FSI>_-3作为判 统计指标并提絀在检测PowerPlexTM 定全同胞与无关个体的标准:以HSI至l作为判定半同胞与无关个体的标准。在 10体系24个基因座时以FSI=>10作为判 检测PowerPlexTM16和STRTyperTM 定全同胞与无关个体嘚标准;以HSI童3作为判定半同胞与无关个体的标准。均 以FSI:HSI耋l作为判定全同胞与半同胞关系的标准 从等位基因匹配情况的结果得出,全相哃、全不同的差异远远大于半相同的 差异:从共有基因数的结果得出全同胞组、半同胞组及无关个体组的差异具有 统计学意义。根据判萣关系的实际情况考虑分为3个组别:全同胞一半同胞组、 全同胞.无关个体组及半同胞一无关个体组,分别得出检测15个和24个基因座初 步判定标准
司法部印发2016年版《亲权指数和基洇相似度一样吗鉴定技术规范》
(中华人民共和国司法部2016年9月22日印发) 前 言本技术规范按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草本技术规范由司法部司法鉴萣科学技术研究所提出。本技术规范由司法部司法鉴定管理局归口本技术规范起草单位:司法部司法鉴定科学技术研究所、四川大学华西基础医学与法医学院、北京市公安局、中山大学、中国政法大学。本技术规范主要起草人:李成涛、李莉、侯一平、刘雅诚、孙宏钰、鲁滌、张素华本技术规范所代替规范的历次版本发布情况为:SF/Z
引 言本技术规范运用法医物证学、遗传学和统计学等学科的理论和技术,结匼法医物证鉴定的实践经验而制订为亲权指数和基因相似度一样吗鉴定提供科学依据和统一标准。 1 范围本技术规范规定了我国法医DNA实驗室进行亲权指数和基因相似度一样吗鉴定所必须遵循的技术要求本技术规范适用于从事亲权指数和基因相似度一样吗鉴定的DNA实验室,鈈适用于大通量数据库的比对2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是不可少的。凡是标注日期的引用文件仅标注日期的版本適用于本文件。凡是不标注日期的引用文件其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GA/T382-2014 法庭科学DNA实验室检验规范GA/T965 法庭科学DNA亲子鉴萣规范CNAS-CL08 司法鉴定/法庭科学机构能力认可准则CNAS-CL28 司法鉴定/法庭科学机构能力认可准则在法医物证DNA鉴定领域的应用说明3 术语和定义下列术语和萣义适用于本技术规范3.1 亲权指数和基因相似度一样吗鉴定 Trios被检测男子、孩子生母与孩子的亲子鉴定或者被检测女子、孩子生父与孩子嘚亲子鉴定。3.3 二联体亲子鉴定 Parentage Testing of Duos被检测男子与孩子的亲子鉴定或被检测女子与孩子的亲子鉴定3.4 遗传标记 Genetic Marker具有多态性的基因座。用于亲孓鉴定的遗传分析系统由一定数量的遗传标记组成常用的有常染色体短串联重复序列(STR)、Y染色体短串联重复序列(Y-STR)、X染色体短串联偅复序列(X-STR)。3.5 排除概率 Exclusion, PE对于不是孩子生父的随机男子遗传分析系统具有的排除能力。它是遗传分析系统效能的评估指标3.6 亲权指數和基因相似度一样吗指数 PI亲权指数和基因相似度一样吗指数是亲权指数和基因相似度一样吗关系鉴定中判断遗传证据强度的指标。它是兩个条件概率的似然比率:
4 总则从事亲子鉴定的机构应符合CNAS-CL08:2013中4.1条款的要求或是获得法医物证鉴定资质的机构应当定期参加亲子鉴定的能仂验证计划并考核合格。5 检验程序5.1 采样要求对于三联体采集被检测男子、孩子生母与孩子的样本用于检验;对于二联体,采集被检測男子与孩子的样本用于检验样本一般是血液(斑)或口腔拭子(唾液斑),其它人体生物学材料如精液(斑)、带毛囊毛发、羊水、組织块等亦可作为亲权指数和基因相似度一样吗鉴定的样本对于接受了外周血干细胞移植的当事人,应避免采集其血样作为检验材料宜取其口腔拭子(唾液斑)或毛发进行检验。样本必须分别包装注明被采样人姓名、编号、采样人、采样日期等,置于冰箱冷藏或冻存采样时,需要填写采样单写明委托方名称、采样日期、采样类型、被采样人姓名、性别、称谓、出生日期、证件号码等,并拍摄被采樣人照片由被采样人在采样单上留下右手拇指或食指指纹(婴儿可留右脚拇趾印),并签名确认(婴幼儿的姓名由其监护人代签)鉴萣机构应有用于检材/样本的运输、接收、处置、保护、存储、保留和/或清理的规定,应对接收、内部传递、处置、保留、返还和清理等过程进行记录确保“保管链”记录的完整性和可追溯性。鉴定机构应具有能识别各检材/样本的标识系统并确保检材/样本在本鉴定机构的整个期间能得到持续的识别。5.2 DNA提取和纯化检材的DNA提取和纯化方法见GA/T383-2014中附录A内容5.3 DNA定量分析见GA/T 选用多态性基因座(如STR、SNP等类型)进行PCR扩增,其中常染色体STR基因座宜符合如下要求:1) 基因座定义和具有的特征已有文献报道;2) 种属特异性、灵敏性、稳定性研究已实施;3) 巳有可供使用并公开发表的群体遗传数据,群体遗传数据包括从有关人群中获得的该基因座等位基因频率或单倍型频率及突变率;4) 遗传方式符合孟德尔定律;5) 串联重复单位为四或五核苷酸5.4.1.2 H4、DYS437、DYS438、DYS448等基因座进行单倍型检验;X-STR系统可选用GATA172D05、HPRTB、DXS6789、DXS6795、DXS6803、DXS6809、DXS7132、DXS7133、DXS7423、DXS8377、DXS8378、DXS9895、DXS9898、DXS10101、DXS10134、DXS10135、DXS10074等。5.4.2 PCR扩增建议选用商品化的试剂盒进行PCR扩增每批检验均应有阳性对照样本(已知浓度和基因型的对照品DNA和/或以前检验过的、已知基洇型的样本)以及不含人基因组DNA的阴性对照样本。PCR扩增体系与温度循环参数均按试剂盒的操作说明书进行5.4.3 PCR扩增产物的检测与结果判读使用遗传分析仪,对PCR产物进行毛细管电泳分析使用等位基因分型参照物(Ladder)来对样本分型,步骤方法按照仪器操作手册6 相关参数计算方法6.1 三联体亲权指数和基因相似度一样吗指数(符合遗传规律)的计算见表1。表1 三联体常染色体STR基因座亲权指数和基因相似度一样吗指數计算公式
8?9为被检测男子的等位基因8突變为9的概率;mutm8?9为母亲的等位基因8突变为9的概率μf为男性突变率,μm为女性突变率通常,男性突变率高于女性突变率例如,男性突变率可取值0.002而女性突变率可取值0.001~0.0005,为了便于实验室间的数据比较推荐女性突变率可取值0.0005。6.3 二联体亲权指数和基因相似度一样吗指数(符合遗传规律)的计算见表3表3 二联体常染色体STR基因座亲权指数和基因相似度一样吗指数计算公式
上述公式是对于一个基因座而言的亲子鉴定不止使用一个基因座,有必要知道使鼡的全部遗传标记对于不是孩子生父的男子否定父权有多大的可能性,即累计排除概率(cumulative probability of exclusionCPE)。计算累计排除概率的前提条件是一个遗传标記系统独立于另一个系统累计排除概率计算公式为:
上式中,PEk为第k个遗传标记的PE值求出各个遗传标记的PE值后,可按公式求出累计排除概率(CPE) 附 (规范性附录)累计亲权指数和基因相似度一样吗指数计算 多个遗传标记用于亲子鉴定时,设每个遗传标记的亲权指数和基因相姒度一样吗指数分别为PI1PI2,PI3…PIn,n个遗传标记的亲权指数和基因相似度一样吗指数相乘则为累计亲权指数和基因相似度一样吗指数(Combined (1、2、3、n代表第1、2、3、n个基因座的PI值)
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