如何构建miRNA 3‘utr突变体序列的进化距离怎么构建

为什么miRNA的作用靶点在3‘UTR而不在5’端?这样的话要首先等到DNA转录完毕才能进行抑制,这不是一种物质及能量的浪费吗?如果靶点在5’端是不是就能避免这种浪费呢?

首先,你提到了UTR这個概念,但是只有mRNA上才有UTR的定义.如果DNA没有转录,就无所谓UTR.所以无论5’还是3’,都已经是DNA转录之后的事情了.
其次,miRNA属于转录后调控,转录后调控的方式囿很多,而且这些调控是不能在转录前进行的.机体是一个精密而复杂的系统,虽然我们现在的科学还不能解释很多东西,但这样的系统是经过自嘫选择的,必然有他的道理.不能说这些调控方式是浪费.
最后,现在miRNA的机制也并不十分清楚,已经有报道miRNA可以作用于mRNA的5’端甚至coding region.你可以找找相关的攵献.

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请问miRNA靶基因验证时怎么突变靶基因的3‘UTR结合位点 - 分子...
例如:靶基因和miRNA的结合位点序列的进化距离怎么构建为:CAUUUCA,那应该怎么突变,不知道是突变其中一个還是几个碱基.看文献有的只突变1个碱基,有的突变2个碱基,不知道有没有什么

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我们组不做机制研究所以

打瓶醬油,坐等大神更新~

而之后的几个“大新闻”发现的又都是3'UTR的位点

后来即使发现了一些特例也是零零星星,没有完全纠正过来


直到这一篇(至少我觉得是这一篇= =)
结合Illumina通过自己发展的CLASH技术和一些简单的生信分析,

最后做出在HEK293细胞系中

但是按这个道理讲,为什么靶点在CDS區的miRNA在前期研究得这么少呢
就是这篇文章,我对众miRNA预测软件大大失望因为

妈蛋,说好的种子区呢

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