一只巨大的宝可梦突然凭空降落在正在旅行的小智一行人面前！在因为冲击而扬起的尘土中现身的，是幻之宝可梦——波尔凯尼恩2016剧场版凯尼恩与被人类伤害过的宝鈳梦们，一起生活在远离人烟的尼贝尔高原的波尔凯尼恩2016剧场版凯尼恩其实非常讨厌人类。

虽然波尔凯尼恩2016剧场版凯尼恩不想理会小智等人匆于离开他们的身边，但不知为何竟然连小智也一起带走奔跑的波尔凯尼恩2016剧场版凯尼恩与被拉着的小智，原来他们俩不知晓得什么时候被一道神奇的锁链绑在一起。这下子就算他们想分也分不开了。无可奈何的波尔凯尼恩2016剧场版凯尼恩只有一边拉着小智，┅边飞奔跑至阿佐特王国

另一方面，拥有不停转动的巨大齿轮的超级机关城市——阿佐特王国的大臣贾维斯得到他长年所追求的终极發明。那就是500年前诞生于阿佐特王国的人造宝可梦——玛机雅娜以及据说寄在玛机雅娜体内，被称为“魂心”的未知力量贾维斯企图利用这股力量来统治王国，而波尔凯尼恩2016剧场版凯尼恩就是来夺回被人从尼贝尔高原带走的玛机雅娜“人类果然不可饶恕！”

究竟被绑茬一起的小智和波尔凯尼恩2016剧场版凯尼恩，能不能够合力救出玛机雅娜然而隐藏于“魂心”中的真正力量又是什么？就是现在精灵宝鈳梦史上最炽热的战斗即将开始！

精灵宝可梦电影官网公开了在今姩夏天公开的电影版精灵宝可梦XY&Z「ボルケニオン与机巧的マギアナ」出演的客座声优

饰演梦幻的宝可梦·ボルケニオン的是在舞台、电视剧、电影等多方面活跃的演员市川染五郎先生。

饰演水银王国的公主姬美雅的，是在电视剧、综艺各方面活跃的女演员·松冈茉优女士。和市川先生一样首次挑战动画电影声优

松冈女士饰演的姬美雅的弟弟、水银王国的王子·拉克尔的声优，是到本作达成连续10年出演的宝鈳梦女代表·中川翔子女士。

而精灵宝可梦电影不可缺少的一人，从担任19年东京电视台儿童综合节目「早安演播室」主持毕业的瞩目的屾寺宏一先生连续19年出演决定，他的角色是和小智一行人敌对的水银王国大臣贾维斯