重复序列 repetitive sequence
的相当于的一股由只有一个复制DNA序列（也称单一DNA，unique sequence，single copy seqence，nonrepetitive sequence等）和具有多数反复存在的DNA顺序组成。称后者为重复顺序。组成基因组的DNA顺序，根据其重复的频度可分为三类。一是基因组只有一个复制顺序的单一DNA，二为高度重复顺序（highly repetitivesequence），由较短的顺序105—107次直线连结而成，其中含随体DNA等。第三为中等程度的重复顺序（moderately repetitive sequence），为有300—500个对的大致相同的顺序——例如在将哺乳类的DNA用AluI（AG↓CT）切断时所产主的主要片断中所见到的高频率（105）的顺序（AluIfamily）——与单一DNA一起分散存在的，以及像RNA基因或基因群那样的多次成直线相连存在的（群）都包含在这一类中。此外有在反方向上重复的顺序（inverted repetitive seq－uence），其变性DNA折叠成（hairpinstructure，foldback structure，snapback stru－cture），在编码分析中可迅速再结合的类型。
上存在的大量无活性的重复DNA序列。其组织形式有两种：；分散重复序列。前一种成簇存在于染色体的特定区域，后一种分散于染色体的各位点上。
大体可分成3大类。（1）高度重复序列：重复几百万次，一般是少于10个组成的短片段。如上的卫星DNA。它们是不翻译的片段。在小鼠中约占基因组的10％。（2）中度重复序列：重复次数为几十次到几千次。在小鼠中约占20％。如rRNA基因、tRNA基因和某些（如组蛋白、、等）的基因。（3）：在整个基因组中只出现一次或少数几次的序列，在小鼠中约占基因组的70％。如基因、基因、基因等。实验证明，所有真核生物染色体可能均含重复序列而一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随真核生物的不同而变化。
重复序列的作用
大量合成蛋白质和
出自A+医学百科 “重复序列”条目
转载请保留此链接
关于“重复序列”的留言：
目前暂无留言The page is temporarily unavailable
nginx error!
The page you are looking for is temporarily unavailable.
Please try again later.
Website Administrator
Something has triggered an error on your
This is the default error page for
nginx that is distributed with
It is located
/usr/share/nginx/html/50x.html
You should customize this error page for your own
site or edit the error_page directive in
the nginx configuration file
/etc/nginx/nginx.conf.[转载]简单重复序列标记技术
真核生物基因组含有分散重复序列和串联重复序列两种类型的重复序列.依据重复序列的长度,拷贝数和位置又将串联重复序列分为卫星DNA(基序长100~300bp,甚至长bp),小卫星DNA(基序长10~60bp),微卫星DNA(基序长1~6bp)和中卫星DNA(由不同大小串联重复组成)等几种类型.微卫星具有许多功能,如重组热点,对基因的调节和表达以及性别决定等.SSR标记即简单重复序列(simple
repeat,SSR)或者微卫星序列(microsatelite,MS),它们广泛分布于各类真核生物基因组的不同位置,如(CA)n,(AT)n,(GGC)n等重复序列,而且分布比较均匀,平均每10kb的DNA序列就会出现一个微卫星序列.SSR标记因为具有共先行,高度重复性，高度丰富的多态性等优点,成为构建遗传连锁图谱,研究群体遗传学,进行分子标记筛选和法医鉴定的理想工具,目前在植物基因组中SSR标记研究非常活跃.SSR标记技术已经应用于拟南芥,大豆,棉花,花生,葡萄,小麦,水稻,番茄,甜菜和油彩等多种植物上.
二.SSR标记技术的概念和原理
一般认为简单重复序列(simple sequence
repeat,SSR)或者微卫星序列(microsatelite,MS),又称为短串联重复(short tandem
repeats,STR)是一类由几个(多为1~6个)碱基组成的基序(motif)串联重复而成的DNA序列,其长度一般较短,在100bp以内.SSR的产生是在DNA复制或修复过程中DNA滑动和错配或者有丝分裂,减数分裂期姐妹染色单体不均等交换的结果.微卫星主要以两个核苷酸为重复单元,也有一些微卫星重复单元为3个核苷酸,少数为4个核苷酸或更多.在对(GT)n,(GA)n,(GATA)n,(GACA)n重复序列进行研究的结果中发现,(GT)n重复序列的拷贝数由酵母的10的2次方拷贝到鼠类基因组的10的5次方拷贝;而(GATA)n的拷贝数在鼠类基因组中约为10的4次方拷贝.SSR
的基序中最常见的是（CA）n和（TG）n。在植物基因组中（AT）n最多；原核基因组中也含有少量的微卫星序列。不同遗传材料重复次数的可变性，导致了SSR长度的高度可变性，这一变异性正是SSR标记产生的基础。微卫星的突变率很高，从而产生了很多等位基因，导致了微卫星的高度多态性。一般认为微卫星丰富的多态性是微卫星不稳定的表现，微卫星的突变率在不同物种、在同一物种的不同位点和同一位点的不同等位基因间存在很大差异。尽管微卫星DNA分布于整个基因组的不同位置，但其两端序列多是保守的单拷贝序列，因此可以根据这两端的序列设计一对特异引物，通过PCR技术将其间的核心微卫星DNA扩增出来，利用电泳分析技术就可获得其长度多态性，即SSR标记。SSR标记的高度多态性主要来源于串联数目的不同。根据分离片段的大小决定基因型，并计算等位基因发生频率。
三．SSR标记技术的特点
由于微卫星寡核苷酸的重复次数在同一物种的不同基因型间差异很大，因而SSR标记呈现高度多态性。另外，微卫星标记还具有简单的孟德尔遗传方式，能用PCR扩增、提供高质量的信息以及在单个微卫星位点上可做共显性的等位基因分析等优点。因此，近年来，微卫星标记已成为比较理想的分子标记。具体而言，SSR标记技术也点如下。
①SSR标记技术一般检测到的是一个单一的多等位基因位点；
②微卫星呈共显性遗传，符合孟德尔遗传方式。故可鉴别杂合子和纯合子，对个体鉴定具特殊意义；
③SSR标记技术所需DNA量少，仅需微量组织。即便DNA降解，其亦能有效地分析鉴定；
④SSR标记位点专化性；
⑤SSR标记数量丰富。标记覆盖整个基因组，而且分布均匀；
⑥实验重复性好，结果可靠性高；
⑦SSR序列两侧顺序长较保守，在同种而不同遗传型间多相同；
⑧多数SSR无功能作用，增加或减少几个重复序列的频率高，因而在品种间具广泛的位点变异，比RFLP及RAPD分子标记具多态性。
但是，利用SSR标记技术进行研究时，由于创建新的标记时需要知道重复序列两端的序列信息，如不能直接从DNA数据库存查寻，则首先必须对其进行测序。因此其开发有一定难度，费用也较高。必须根据微卫星侧翼序列设计引物，减少了其应用范围。虽然开始筛选重复序列和引物设计过程较慢，但只要引物确定，使用便极为简单，结果极为稳定。
以上网友发言只代表其个人观点，不代表新浪网的观点或立场。中度重复序列 - 分子生物 - 生物秀
标题: 中度重复序列
中度重复序列大致指在真核基因组中重复数十至数万（……
中度重复序列大致指在真核基因组中重复数十至数万（&105）次的重复顺序。其复性速度快于单拷贝顺序，但慢于高度重复顺序。少数在基因组中成串排列在一个区域，大多数与单拷贝基因间隔排列。依据重复顺序的长度，中度重复顺序可分为两种类型。
（1）短分散片段（short interspersed repeated segments, SINES）这类重复顺序的平均长度约为300bp（〈500bp），它们与平均长度约为1000bp的单拷贝顺序间隔排列。拷贝数可达10万左右。如Alu家族，Hinf家族等属于这种类型的中度重复序列。
（2）长分散片段（Long interspersed repeated segments, LINES）这类重复顺序的长度大于1000bp，平均长度为bp，它们与平均长度为13000bp（个别长几万bp）的单拷贝顺序间隔排列。也有的实验显示人基因组中所有LINES之间的平均距离为2.2kb,拷贝数一般在1万左右，如KpnⅠ家族等。中度重复顺序在基因组中所占比例在不同种属之间差异很大，一般约占10-40％，在人约为12％。这些顺序大多不编码蛋白质。这些非编码的中度重复顺序的功能可能类似于高度重复顺序。在结构基因之间，基因簇中，以及内含子内都可以见到这些短的和长的中度重复顺序。按本文的分类原则有些中度重复顺序则是编码蛋白质或rRNA的结构基因，如HLA基因，rRNA基因，tRNA基因,组蛋白基因,免疫球蛋白基因等。中度重复顺序一般具有种特异性；在适当的情况下，可以应用它们作为探针区分不同种哺乳动物细胞的DNA。下面介绍几种典型的中度重复顺序。
Alu家族：Alu家族是哺乳动物包括人基因组中含量最丰富的一种中度重复顺序家族，在单倍体人基因组中重复达30万-50万次，约占人基因组的3-6％。Alu家族每个成员的长度约300bp，由于每个单位长度中有一个限制性内切酶Alu的切点（AG&CT）从而将其切成长130和170bp的两段，因而定名为Alu序列（或Alu家族）。Alu序列分散在整个人体或其他哺乳动物基因组中，在间隔DNA，内含子中都发现有Alu序列，平均每5kbDNA就有一个Alu顺序。已建立的基因组中无例外地含有Alu顺序。Alu顺序具有种的特异性，人的Alu顺序制备的探针只能用于检测人的基因组中的Alu序列。由于在大多数的含有人的DNA的克隆中都含有Alu顺序，因此，可以这样认为，用人的Alu序列制备的探针与要筛选的克隆杂交，阳性者即为含有人DNA克隆，阴性者不含有人DNA。序列分析表明人类Alu顺序是由两个约130bp的正向重复构成的二聚体，而在第二个单体中有一个31bp的插入序列，该插入序列在Alu家族的不同成员之间核苷酸顺序相似但不相同。每个Alu顺序两侧为6-20bp的正向重复顺序，不同的Alu成员的侧翼重复顺序也各不相同。Alu序列的5&端比较保守，但富含脱氧腺苷酸残基的3&端在不同的Alu成员中是有变化的。在相近的体中Alu家族在结构上存在相似性，一般认为灵长类基因组中的Alu顺序多为由两个130bp的正向重复组成的二聚体，而啮类动物则为由一个130bp左右的DNA片段组成的单体。Alu序列在不同的哺乳动物之间存在着一定的相似性，但其序列相差较大，不会产生交叉杂交。Alu顺序广泛散布于整个基因组的原因可能是由于Alu顺序可由RNA转录成RNA分子，再经的作用形成c,然后重新插入基因组所致。也有人认为Alu序列两侧存在着短的重复顺序，使得Alu顺序很象转座子，因此推测Alu顺序可能也是能够移动的。这可能是它们在整个基因组中含量如此丰富，颁布如此广泛的原因之一。Alu家族的功能是多方面的，由于在许多核内不均一RNA(hnRNA)中含有大量的Alu顺序，而且，Alu顺序含有与某些真核基因内含子剪接接头相似的序列，因而，Alu顺序可能参与hnRNA的加工与成熟。Alu序列在人基因组中不寻常地大量存在，提示它与遗传重组及染色体不稳定性有关。最近发现在人的组织细胞中存在自然发生的染色体外双链环状DAN，被称为人类质粒（human plasmid），而这些质粒又毫无例外地含有Alu顺序。还有研究表明，Alu顺序中的某些区段有形成Z-的能力。另外，Alu顺序可能具有转录调节作用。
相关热词：
..........
生物秀是目前国内最具影响力的生物医药门户网站之一，致力于IT技术和BT的跨界融合以及生物医药领域前沿技术和成功商业模式的传播。为生物医药领域研究人员和企业提供最具价值的行业资讯、专业技术、学术交流平台、会议会展、电子商务和求职招聘等一站式服务。
官方微信号：shengwuxiu
电话：021-[转载]简单重复序列标记技术
真核生物基因组含有分散重复序列和串联重复序列两种类型的重复序列.依据重复序列的长度,拷贝数和位置又将串联重复序列分为卫星DNA(基序长100~300bp,甚至长bp),小卫星DNA(基序长10~60bp),微卫星DNA(基序长1~6bp)和中卫星DNA(由不同大小串联重复组成)等几种类型.微卫星具有许多功能,如重组热点,对基因的调节和表达以及性别决定等.SSR标记即简单重复序列(simple
repeat,SSR)或者微卫星序列(microsatelite,MS),它们广泛分布于各类真核生物基因组的不同位置,如(CA)n,(AT)n,(GGC)n等重复序列,而且分布比较均匀,平均每10kb的DNA序列就会出现一个微卫星序列.SSR标记因为具有共先行,高度重复性，高度丰富的多态性等优点,成为构建遗传连锁图谱,研究群体遗传学,进行分子标记筛选和法医鉴定的理想工具,目前在植物基因组中SSR标记研究非常活跃.SSR标记技术已经应用于拟南芥,大豆,棉花,花生,葡萄,小麦,水稻,番茄,甜菜和油彩等多种植物上.
二.SSR标记技术的概念和原理
一般认为简单重复序列(simple sequence
repeat,SSR)或者微卫星序列(microsatelite,MS),又称为短串联重复(short tandem
repeats,STR)是一类由几个(多为1~6个)碱基组成的基序(motif)串联重复而成的DNA序列,其长度一般较短,在100bp以内.SSR的产生是在DNA复制或修复过程中DNA滑动和错配或者有丝分裂,减数分裂期姐妹染色单体不均等交换的结果.微卫星主要以两个核苷酸为重复单元,也有一些微卫星重复单元为3个核苷酸,少数为4个核苷酸或更多.在对(GT)n,(GA)n,(GATA)n,(GACA)n重复序列进行研究的结果中发现,(GT)n重复序列的拷贝数由酵母的10的2次方拷贝到鼠类基因组的10的5次方拷贝;而(GATA)n的拷贝数在鼠类基因组中约为10的4次方拷贝.SSR
的基序中最常见的是（CA）n和（TG）n。在植物基因组中（AT）n最多；原核基因组中也含有少量的微卫星序列。不同遗传材料重复次数的可变性，导致了SSR长度的高度可变性，这一变异性正是SSR标记产生的基础。微卫星的突变率很高，从而产生了很多等位基因，导致了微卫星的高度多态性。一般认为微卫星丰富的多态性是微卫星不稳定的表现，微卫星的突变率在不同物种、在同一物种的不同位点和同一位点的不同等位基因间存在很大差异。尽管微卫星DNA分布于整个基因组的不同位置，但其两端序列多是保守的单拷贝序列，因此可以根据这两端的序列设计一对特异引物，通过PCR技术将其间的核心微卫星DNA扩增出来，利用电泳分析技术就可获得其长度多态性，即SSR标记。SSR标记的高度多态性主要来源于串联数目的不同。根据分离片段的大小决定基因型，并计算等位基因发生频率。
三．SSR标记技术的特点
由于微卫星寡核苷酸的重复次数在同一物种的不同基因型间差异很大，因而SSR标记呈现高度多态性。另外，微卫星标记还具有简单的孟德尔遗传方式，能用PCR扩增、提供高质量的信息以及在单个微卫星位点上可做共显性的等位基因分析等优点。因此，近年来，微卫星标记已成为比较理想的分子标记。具体而言，SSR标记技术也点如下。
①SSR标记技术一般检测到的是一个单一的多等位基因位点；
②微卫星呈共显性遗传，符合孟德尔遗传方式。故可鉴别杂合子和纯合子，对个体鉴定具特殊意义；
③SSR标记技术所需DNA量少，仅需微量组织。即便DNA降解，其亦能有效地分析鉴定；
④SSR标记位点专化性；
⑤SSR标记数量丰富。标记覆盖整个基因组，而且分布均匀；
⑥实验重复性好，结果可靠性高；
⑦SSR序列两侧顺序长较保守，在同种而不同遗传型间多相同；
⑧多数SSR无功能作用，增加或减少几个重复序列的频率高，因而在品种间具广泛的位点变异，比RFLP及RAPD分子标记具多态性。
但是，利用SSR标记技术进行研究时，由于创建新的标记时需要知道重复序列两端的序列信息，如不能直接从DNA数据库存查寻，则首先必须对其进行测序。因此其开发有一定难度，费用也较高。必须根据微卫星侧翼序列设计引物，减少了其应用范围。虽然开始筛选重复序列和引物设计过程较慢，但只要引物确定，使用便极为简单，结果极为稳定。
以上网友发言只代表其个人观点，不代表新浪网的观点或立场。}