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关于使用MS建立石墨烯超胞的问题，菜鸟求救
想建立一个石墨烯4X4超胞的吸附模型，首先在建立石墨烯超胞的问题上被卡主了，在帖子http://emuch.net/html/0856.html上看到MS中建立石墨烯模型
想请教大家两个问题：
首先引用原文：
Sample Text
最近为了在VASP中弛豫石墨烯，要在在MS中建立石墨烯模型，总结了一下步骤，仅供参考：
1、打开material studio，新建一个工程，import石墨graphite.msi，在structure/ceramic中
2、build-&make p1（目的是消除对称性，这样才能够删除一层原子）。
3、删除一层原子（选中原子-&delete），并移动剩下的原子到中间。
4、构建supercell（方便掺杂，也为了好看）：build-&symetry-&supercell，构建一个6*6*1的超原胞，这样建立的超胞模型是扶手型。
要建立锯齿状的，在建立supercell之前，build&symmetry&find symmetry,然后impose symmetry，此时只显示两个原子，然后建立supercell，6*6*1
（如果需要supercell是斜六面体，这样就可以了，如果需要矩形，继续下一步）
5、修改晶格参数：build-&crystal-&rebuild crystal，设置方位角和length。由斜六面体改为矩形首先改方位角，如果只改方位角，会发现周期性边界变化，
所以还要修改length，修改以后变成矩形。我的是6*6*1,a：12.78，b:12.2999
6、下面就是需要导出到VASP中
点击castep计算energy，保存file，到相应文件夹下找到graphite (66-cub).cell文件，此文件为隐含文件，打开，把相应的lattice parameter和坐标拷到POSCAR，就搞定了。
1.3、删除一层原子（选中原子-&delete），并移动剩下的原子到中间。
MS中怎么将剩下的原子准确的移动到中间？用move to工具吗？具体如何操作？怎么总是移动不了？
2.5、修改晶格参数：build-&crystal-&rebuild crystal，设置方位角和length。由斜六面体改为矩形首先改方位角，如果只改方位角，会发现周期性边界变化，
所以还要修改length，修改以后变成矩形。我的是6*6*1,a：12.78，b:12.2999
这里将斜六面体改为矩形是什么意思?是说改了之后，整个超胞的形状就由六面体改成了矩形吗？另外如果我建立的是4X4超胞，那么a,b应该是多少？换句话说，a,b的取值与晶格常数存在何种关系？
请大家帮帮忙，急
虽然我刚刚自己摸索出来了，但是还是感谢大神的鼎力相助！请继续关注我，我还会提出许多白痴问题，请大神给予指教啊！
大侠，请移步这里：http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=6380006
对于一个6*6*1的晶胞，为什么在b方向上是5个呀？
领教了，谢谢！
哦&&谢谢！
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1. 应当使用多少个k网格？很难一般地回答，只能给出一般建议。注意：一定要检查k网格，首先用较粗糙的网格计算，接下来用精细的网格计算。通过比较两次的结果，决定选用较粗糙的网格，或是继续进行更精细网格的计算，直到达到收敛。金属体系需要精细的网格，绝缘体使用很少的k点通常就可以。小单胞需要精细格点，大单胞很可能不需要。因此：单位晶胞内原子数很多（比如40-60个）的绝缘体，可能仅需要一个（移动后的）k点。另一方面，面心立方的铝可能需要上万个k点以获得好的DOS。对于孤立原子或分子的超晶胞，仅需要在Gamma点计算。对于表面（层面）的超晶胞计算，仅需要（垂直于表面）z方向上有1个k点。甚至可以增加晶格参数c，这样即使对精细格点，沿z方向上也只产生一个k点（产生k点后，不要忘记再把c改回）。2. 当体系没有出现时间反演对称操作时，是否加入？大多数情况下的回答是“是”，只有包含自旋-轨道耦合的自旋极化（磁性）计算除外。这时，时间反演对称性被破坏（+k和-k的本征值可能不同），因此决不能加入时间反演对称性。3. 是否移动k网格？（只对某些格子类型有效）“移动”k网格意味着把所有产生的k点增加 x,x,x ，把那些位于高对称点（或线）上的k点移动到权重更大的一般点上。通过这种方法（也即众所周知的“特殊k点方法”）可以产生等密度的，k点较少的网格。通常建议移动。只有一点注意：当对半导体的带隙感兴趣时（通常位于Gamma，X，或BZ边界上的其它点），使用移动的网格将不会得到这些高对称性的点，因此得到的带隙和预期结果相比或大或小。这个问题的解决：用移动的网格做SCF循环，但对DOS计算，改用精细的未移动网格。
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