细菌分类目录
细菌属于细菌界，原核生物域。原核生物域分两界：细菌界、古细菌界。 & &l 酸杆菌门(Acidobacteria)l & & & 酸杆菌纲(Acidobacteria)n & & & 酸杆菌目(Acidobacteriales)l & & & 酸杆菌科(Acidobacteriaceae)u & & 酸杆菌属(Acidobacterium)u & & (Edaphobacter)u & & (Terriglobus)l & & & 全噬菌纲(Holophagae)n & & & 石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)l & & & 石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)u & & 石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)n & & & 全噬菌目(Holophagales)l & & & 全噬菌科(Holophagaceae)u & & 地发菌属(Geothrix)u & & 全噬菌属(Holophaga)l & & 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌）l & & & 放线菌纲(Actinobacteria)n & & & 酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)l & & & 酸微菌目(Acidimicrobiales)u & & 酸微菌亚目(Acidimicrobineae)l & & & 酸微菌科(Acidimicrobiaceae)u & & 酸微菌属(Acidimicrobium)l & & & (Iamiaceae)u & & (Iamia)n & & & 放线菌亚纲(Actinobacteridae)l & & & 放线菌目(Actinomycetales)u & & 放线菌亚目(Actinomycineae)l & & & 放线菌科(Actinomycetaceae)u & & 放线棒菌属(Actinobaculum)u & & 放线菌属(Actinomyces)u & & 隐秘杆菌属(Arcanobacterium)u & & (Falcivibrio)u & & 动弯杆菌属(Mobiluncus)u & & (Varibaculum)u & & (Actinopolysporineae)l & & & (Actinopolysporaceae)u & & (Actinopolyspora)u & & (Catenulisporineae)l & & & (Actinospicaceae)u & & (Actinospica)l & & & (Catenulisporaceae)u & & (Catenulispora)u & & 棒杆菌亚目(Corynebacterineae)l & & & 棒杆菌科(Corynebacteriaceae)u & & (Bacterionema)u & & (Caseobacter)u & & 棒杆菌属(Corynebacterium)u & & (Turicella)l & & & 迪茨氏菌科(Dietziaceae)u & & 迪茨氏菌属(Dietzia)l & & & 分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)u & & 分枝杆菌属(Mycobacterium) （含结核杆菌）l & & & 诺卡氏菌科(Nocardiaceae)u & & 戈登氏菌属(Gordonia)u & & (Micropolyspora)u & & (Millisia)u & & 诺卡氏菌属(Nocardia)u & & 红球菌属(Rhodococcus)u & & 斯科曼氏菌属(Skermania)u & & (Williamsia)u & & (Smaragdicoccus)l & & & (Segniliparaceae)u & & (Segniliparus)l & & & 束村氏菌科(Tsukamurellaceae)u & & 束村氏菌属(Tsukamurella)u & & 弗兰克氏菌亚目(Frankineae)l & & & 酸热菌科(Acidothermaceae)u & & 酸热菌属(Acidothermus)l & & & 弗兰克氏菌科(Frankiaceae)u & & 弗兰克氏菌属(Frankia)l & & & 地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)u & & 芽球菌属(Blastococcus)u & & 地嗜皮菌属(Geodermatophilus)u & & (Modestobacter)l & & & (Kineosporiaceae)u & & (Cryptosporangium)u & & (Kineococcus)u & & (Kineosporia)l & & & (Nakamurellaceae)u & & (Humicoccus)u & & (Nakamurella)u & & (Quadrisphaera)l & & & 孢鱼菌科(Sporichthyaceae)u & & 孢鱼菌属(Sporichthya)u & & 糖霉菌亚目(Glycomycineae)l & & & 糖霉菌科(Glycomycetaceae)u & & 糖霉菌属(Glycomyces)u & & (Stackerbrandtia)u & & 微球菌亚目(Micrococcineae)l & & & 获山氏菌科(Beutenbergiaceae)u & & 获山氏菌属(Beutenbergia)u & & 乔治菌属(Georgenia)u & & 萨勒河菌属(Salana)l & & & 博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)u & & 博戈里亚湖菌属(Bogoriella)l & & & 短杆菌科(Brevibacteriaceae)u & & 短杆菌属(Brevibacterium)l & & & 纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)u & & 纤维素单胞菌属(Cellulomonas)u & & 厄氏菌属(Oerskovia)u & & (Tropheryma)l & & & (Dermabacteraceae)u & & (Brachybacterium)u & & (Dermabacter)l & & & (Dermacoccaceae)u & & (Demetria)u & & (Dermacoccus)u & & (Kytococcus)l & & & (Dermatophilaceae)u & & (Dermatophilus)u & & (Kineosphaera)l & & & (Intrasporangiaceae)u & & (Arsenicicoccus)u & & (Humihabitans)u & & (Intrasporangium)u & & (Janibacter)u & & (Knoellia)u & & (Kribbia)u & & (Lapillicoccus)u & & (Ornithinicoccus)u & & (Ornithinimicrobium)u & & (Oryzihumus)u & & (Serinicoccus)u & & (Terrabacter)u & & (Terracoccus)u & & (Tetrasphaera)l & & & (Jonesiaceae)u & & (Jonesia)l & & & (Microbacteriaceae)u & & (Agreia)u & & (Agrococcus)u & & (Agromyces)u & & (Aureobacterium)u & & (Clavibacter)u & & (Cryobacterium)u & & (Curtobacterium)u & & (Frigoribacterium)u & & (Frondicola)u & & (Gulosibacter)u & & (Labedella)u & & (Leifsonia)u & & (Leucobacter)u & & (Microbacterium)u & & (Microcella)u & & (Mycetocola)u & & (Okibacterium)u & & (Plantibacter)u & & (Pseudoclavibacter)u & & (Rathayibacter)u & & (Rhodoglobus)u & & (Salinibacterium)u & & (Subtercola)u & & (Yonghaparkia)u & & (Zimmermannella)l & & & 微球菌科(Micrococcaceae)u & & (Acaricomes)u & & 节杆菌属(Arthrobacter)u & & (Citricoccus)u & & (Kocuria)u & & 微球菌属(Micrococcus)u & & (Nesterenkonia)u & & (Renibacterium)u & & 罗氏菌属(Rothia)u & & 口腔球菌属(Stomatococcus)u & & 刘志恒菌属(Zhihengliuella)l & & & (Promicromonosporaceae)u & & (Cellulosimicrobium)u & & (Isoptericola)u & & (Myceligenerans)u & & (Promicromonospora)u & & (Xylanibacterium)u & & (Xylanimonas)l & & & (Rarobacteraceae)u & & (Rarobacter)l & & & (Sanguibacteraceae)u & & 血杆菌属(Sanguibacter)l & & & (Yaniaceae)u & & (Yania)l & & & 科未定u & & (Actinotalea)u & & (Demequina)u & & (Phycicoccus)u & & (Ruania)u & & 微单孢菌亚目(Micromonosporineae)l & & & 微单孢菌科(Micromonosporaceae)u & & (Actinocatenispora)u & & (Actinoplanes)u & & (Amorphosporangium)u & & (Ampullariella)u & & (Asanoa)u & & (Catellatospora)u & & (Catenuloplanes)u & & (Couchiolanes)u & & (Dactylosporangium)u & & (Krasilnikovia)u & & (Longispora)u & & (Luedemannella)u & & 微单孢菌属(Micromonospora)u & & (Pilimelia)u & & (Planopolyspora)u & & (Polymorphospora)u & & (Salinispora)u & & (Spirilliplanes)u & & (Verrucosispora)u & & (Virgisporangium)u & & 丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)l & & & (Nocardioidaceae)u & & (Actinopolymorpha)u & & (Aeromicrobium)u & & (Friedmanniella)u & & (Hongia)u & & (Kribbella)u & & (Marmoricola)u & & (Micropruina)u & & (Nocardioides)u & & (Pimelobacter)u & & (Propionicicella)u & & (Propionicimonas)l & & & 丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)u & & 河口微菌属(Aestuariimicrobium)u & & (Arachnia)u & & (Brooklawnia)u & & (Granulicoccus)u & & 江氏菌属(Jiangella)u & & (Luteococcus)u & & (Microlunatus)u & & 丙酸杆菌属(Propionibacterium)u & & (Propioniferax)u & & (Propionimicrobium)u & & (Tessaracocccus)u & & (Pseudonocardineae)l & & & (Actinosynnemataceae)u & & (Actinokineospora)u & & (Actinosynnema)u & & (Lechevalieria)u & & (Lentzea)u & & (Saccharothrix)u & & (Umezawaea)l & & & (Pseudonocardiaceae)u & & (Actinoalloteichus)u & & (Actinobispora)u & & (Amycolata)u & & (Amycolatopsis)u & & (Crossiella)u & & (Faenia)u & & (Goodfellowia)u & & (Kibdelosporangium)u & & (Kutzneria)u & & (Prauserella)u & & (Pseudoamycolata)u & & (Pseudonocardia)u & & (Saccharomonospora)u & & (Saccharopolyspora)u & & (Streptoalloteichus)u & & (Thermobispora)u & & (Thermocrispum)u & & 链霉菌亚目(Streptomycineae)l & & & 链霉菌科(Sterptomycetaceae)u & & (Actinopycnidium)u & & (Actinosporangium)u & & (Chainia)u & & (Elytrosporangium)u & & 北里菌属(Kitasatoa)u & & 北里孢菌属(Kitasatospora)u & & (Microellobosporia)u & & (Streptacidiphilus)u & & 链霉菌属(Streptomyces)u & & (Streptoverticillium)u & & (Streptosporangineae)l & & & (Nocardiopsaceae)u & & (Nocardiopsis)u & & (Streptomonospora)u & & (Thermobifida)l & & & (Streptosporangiaceae)u & & (Acrocarpospora)u & & (Herbidospora)u & & (Microbispora)u & & (Microtetraspora)u & & (Nonomuraea)u & & (Planobispora)u & & (Planomonospora)u & & (Planotetraspora)u & & (Sphaerisporangium)u & & (Streptosporangium)u & & (Thermopolyspora)l & & & (Thermomonosporaceae)u & & 珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)u & & (Actinomadura)u & & (Excellospora)u & & (Spirillospora)u & & (Thermomonospora)l & & & 双歧杆菌目(Bifidobacteriales)u & & 双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)l & & & (Aeriscardovia)l & & & (Alloscardovia)l & & & 双歧杆菌属(Bifidobacterium)l & & & (Gardnerella)l & & & (Metascardovia)l & & & (Parascardovia)l & & & (Scardovia)u & & 科未定n & & & (Coriobacteridae)l & & & (Coriobacteriales)u & & (Coriobacterineae)l & & & (Coriobacteriaceae)u & & 奇异菌属(Atopobium)u & & (Collinsella)u & & (Coriobacterium)u & & (Cryptobacterium)u & & (Denitrobacterium)u & & (Eggerthella)u & & (Olsenella)u & & (Slackia)n & & & 红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)l & & & 红色杆菌目(Rubrobacterales)u & & 红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)l & & & (Conexibacteraceae)u & & (Conexibacter)l & & & (Patulibacteraceae)u & & (Patulibacter)l & & & 红色杆菌科(Rubrobacteraceae)u & & 红色杆菌属(Rubrobacter)l & & & (Solirubrobacteraceae)u & & (Solirubrobacter)l & & & (Thermoleophilaceae)u & & (Thermoleophilum)n & & & 球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae)l & & & 球形杆菌目(Sphaerobacterales)u & & 球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae)l & & & 球形杆菌科(Sphaerobacteraceae)u & & 球形杆菌属(Sphaerobacter)l & & 产水菌门(Aquificae)l & & & 产水菌纲(Aquificae)n & & & 产水菌目(Aquificales)l & & & 产水菌科(Aquificaceae)u & & 产水菌属(Aquifex)u & & (Calderobacterium)u & & (Hydrogenivirga)u & & (Hydrogenobacter)u & & (Hydrogenobaculum)u & & (Thermocrinis)l & & & 除硫杆菌科(Desulfurobacteriaceae)u & & (Balnearium)u & & 除硫杆菌属(Desulfurobacterium)u & & 热弧菌属(Thermovibrio)l & & & (Hydrogenothermaceae)u & & (Hydrogenothermus)u & & (Persephonella)u & & (Sulfurihydrogenibium)l & & 拟杆菌门(Bacteroidetes)l & & & 拟杆菌纲(Bacteroidetes)n & & & 拟杆菌目(Bacteroidales)l & & & 拟杆菌科(Bacteroidaceae)u & & (Acetomicrobium)u & & (Anaerophaga)u & & (Anaerorhabdus)u & & 拟杆菌属(Bacteroides)u & & (Pontibacter)l & & & 紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)u & & (Barnesiella)u & & (Capsularis)u & & (Dysgonomonas)u & & (Hallella)u & & (Odoribacter)u & & (Oribaculum)u & & (Paludibacter)u & & (Parabacteroides)u & & 紫单胞菌属(Porphyromonas) （多译作“卟啉单胞菌”，但porphyro-应来源于希腊语“紫色”）u & & (Proteiniphilum)u & & (Tannerella)u & & (Xylanibacter)l & & & 普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)u & & 普雷沃氏菌属(Prevotella) （或译作“普氏菌”）l & & & 理研菌科(Rikenellaceae)u & & (Alistipes)u & & (Alkaliflexus)u & & (Marinilabilia)u & & (Petrimonas)u & & 理研菌属(Rikenella)（注：Riken是日语“理化学研究所”简称）l & & & 科未定u & & (Acetofilamentum)u & & (Acetothermus)l & & & 黄杆菌纲(Flavobacteria)n & & & 黄杆菌目(Flavobacteriales)l & & & 蟑螂杆状体科(Blattabacteriaceae)u & & 蟑螂杆状体属(Blattabacterium)l & & & (Cryomorphaceae)u & & (Algoriphagus)u & & (Brumimicrobium)u & & (Crocinitomix)u & & (Cryomorpha)u & & (Fluviicola)u & & 李时珍菌属(Lishizhenia)u & & (Owenweeksia)l & & & 黄杆菌科(Flavobacteriaceae)u & & (Actibacter)u & & (Aequorivita)u & & (Algibacter)u & & (Aquimarina)u & & (Arenibacter)u & & 伯杰菌属(Bergeyella)u & & (Bizionia)u & & 碳酸噬胞菌属(Capnocytophaga) （注：多译作“二氧化碳噬纤维菌属”）u & & 噬纤维素菌属(Cellulophaga)u & & 金黄杆菌属(Chryseobacterium)u & & (Cloacibacterium)u & & (Coenonia)u & & (Costertonia)u & & (Croceibacter)u & & 独岛菌属(Dokdonia)u & & 东海菌属(Donghaeana)u & & (Elizabethkingia)u & & (Empedobacter)u & & (Epilithonimonas)u & & (Flaviramulus)u & & 黄杆菌属(Flavobacterium)u & & (Formosa)u & & 泥滩杆菌属(Gaetbulibacter)u & & 泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium)u & & (Galbibacter)u & & (Gelidibacter)u & & (Gillisia)u & & (Gilvibacter)u & & 革兰菌属(Gramella)u & & (Kaistella)u & & (Kordia)u & & (Krokinobacter)u & & (Lacinutrix)u & & 列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella)u & & (Lutibacter)u & & (Maribacter)u & & (Mariniflexile)u & & (Marixanthomonas)u & & (Mesonia)u & & (Muricauda)u & & (Myroides)u & & (Nonlabens)u & & (Olleya)u & & (Ornithobacterium)u & & (Persicivirga)u & & (Pibocella)u & & 极地杆菌属(Polaribacter)u & & 冷弯菌属(Psychroflexus)u & & (Psychroserpens)u & & (Riemerella)u & & (Robiginitalea)u & & (Salegentibacter)u & & (Sandarakinotalea)u & & (Sediminibacter)u & & (Sediminicola)u & & 世宗菌属(Sejongia)u & & (Stanierella)u & & (Stenothermobacter)u & & (Subsaxibacter)u & & (Subsaximicrobium)u & & (Tamlana)u & & (Tenacibaculum)u & & (Ulvibacter)u & & (Vitellibacter)u & & (Wautersiella)u & & (Weeksella)u & & (Winogradskyella)u & & 丽水菌属(Yeosuana)u & & (Zeaxanthinibacter)u & & 周氏菌属(Zhouia)u & & (Zobellia)u & & 王祖农菌属(Zunongwangia)l & & & 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)n & & & 鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)l & & & 泉发菌科(Crenotrichaceae)u & & (Balneola)u & & (Chitinophaga)u & & 泉发菌属(Crenothrix)u & & (Rhodothermus)u & & (Salinibacter)u & & (Terrimonas)u & & (Toxothrix)l & & & (Flammeovirgaceae)u & & (Flammeovirga)u & & (Flexithrix)u & & (Perexilibacter)u & & (Persicobacter)u & & (Rapidithrix)u & & (Sediminitomix)u & & (Thermonema)l & & & 屈挠杆菌科(Flexibacteraceae)u & & (Adhaeribacter)u & & (Aquiflexum)u & & (Arcicella)u & & (Belliella)u & & (Chimaereicella)u & & (Cyclobacterium)u & & 噬胞菌属(Cytophaga)（注：目前多称此属为“噬纤维菌属”，此处依拉丁文）u & & (Dyadobacter)u & & (Echinicola)u & & (Effluviibacter)u & & (Emticicia)u & & (Fabibacter)u & & (Flectobacillus)u & & 屈挠杆菌属(Flexibacter)u & & (Hongiella)u & & (Hymenobacter)u & & (Larkinella)u & & (Leadbetterella)u & & (Marinicola)u & & (Meniscus)u & & (Microscilla)u & & (Niastella)u & & (Persicitalea)u & & (Reichenbachiella)u & & (Rhodonellum)u & & (Roseivirga)u & & (Runella)u & & (Spirosoma)u & & 生孢噬胞菌属(Sporocytophaga)l & & & 腐螺旋菌科(Saprospiraceae)u & & (Aureispira)u & & (Haliscomenobacter)u & & (Lewinella)u & & 腐螺旋菌属(Saprospira)l & & & 鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)u & & (Mucilaginibacter)u & & (Olivibacter)u & & (Parapedobacter)u & & (Pedobacter)u & & (Pseudosphingobacterium)u & & 鞘脂杆菌属(Sphingobacterium)l & & & 科未定u & & (Niabella)l & & & 纲未定n & & & (Flavisolibacter)n & & & (Fulvivirga)n & & & (Prolixibacter)n & & & (Segetibacter)l & & 衣原体门(Chlamydiae)l & & & 衣原体纲(Chlamydiae)n & & & 衣原体目(Chlamydiales)l & & & 衣原体科(Chlamydiaceae)u & & 衣原体属(Chlamydia)u & & 嗜衣体属(Chlamydophila)l & & & 副衣原体科(Parachlamydiaceae)u & & 新衣原体属(Neochlamydia)u & & 副衣原体属(Parachlamydia)l & & & 芯卡体科(Simkaniaceae)u & & 芯卡体属(Simkania)（注：人名缩写简称，此处用音译）u & & 棍衣原体属(Rhabdochlamydia)*l & & & 华诊体科(Waddliaceae)u & & 华诊体属(Waddlia)（注：WADDL为“华盛顿动物病诊断实验室”缩写）l & & 绿菌门(Chlorobi)l & & & 绿菌纲(Chlorobia)n & & & 绿菌目(Chlorobiales)l & & & 绿菌科(Chlorobiaceae)u & & 臂绿菌属(Ancalochloris)u & & 绿棒菌属(Chlorobaculum)u & & 绿菌属(Chlorobium)u & & 绿爬菌属(Chloroherpeton)u & & 暗网菌属(Pelodictyon)u & & 突柄绿菌属(Prosthecochloris)l & & 绿弯菌门(Chloroflexi)l & & & 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)n & & & 厌氧绳菌目(Anaerolineales)l & & & 厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)u & & 厌氧绳菌属(Anaerolinea)u & & (Bellilinea)u & & 纤绳菌属(Leptolinea)u & & (Levilinea)u & & 长绳菌属(Longilinea)l & & & 暖绳菌纲(Caldilineae)n & & & 暖绳菌目(Caldilineales)l & & & 暖绳菌科(Caldilineaceae)u & & 暖绳菌属(Caldilinea)l & & & 绿弯菌纲(Chloroflexi)n & & & 绿弯菌目(Chloroflexales)l & & & 绿弯菌科(Chloroflexaceae)u & & 绿弯菌属(Chloroflexus)u & & 绿线菌属(Chloronema)u & & 太阳发菌属(Heliothrix)u & & 玫瑰弯菌属(Roseiflexus)l & & & 颤绿菌科(Oscillochloridaceae)u & & 颤绿菌属(Oscillochloris)n & & & 爬管菌目(Herpetosiphonales)l & & & 爬管菌科(Herpetosiphonaceae)u & & 爬管菌属(Herpetosiphon)l & & & 产金菌纲(Chrysiogenetes)n & & & 产金菌目(Chrysiogenales)l & & & 产金菌科(Chrysiogenaceae)u & & 产金菌属(Chrysiogenes)l & & 蓝藻门(Cyanobacteria)l & & & 蓝藻纲(Cyanobacteria)l & & & 注：目前有三套蓝藻分类系统，分别为NCBI、Bergey's手册及Cavalier-Smith（2002年，仅分至目)。l & & & 本文采用的Bergey's手册中蓝藻内的分类，不论目科属，均为形态分类，其中目在手册中为“Subsection”而非“Order”，目、科均未列名称，此处目名称为习惯用法，科不列名称；属除Halospirulina和Trichodesmium之外均标为“形态属”(Form Genus)而非“属”(Genus)。表中在形态分类后面加注&@&。预料不久的将来整个蓝藻分类系统将会大调，与其它细菌统一为系统发育分类系统。l & & & 此外，因汉语“藻”字可指多种水生光合产氧生物，包括多支互不相关的原生生物甚至高等水生植物，此处仍用按照“藻”翻译蓝藻门(Cyanobacteria)细菌。但也可依据个人理念将名称定为“某菌”或“某蓝菌”，但应注意避免与其余细菌重名。n & & & 第一目（色球藻目(Chroococcales)l & & & 第一科u & & 管孢藻属(Chamaesiphon)u & & 色球藻属(Chroococcus)u & & (Cyanobacterium)u & & (Cyanobium)u & & (Cyanothece)u & & 蓝纤维藻属(Dactylococcopsis)u & & (Gloeobacter)u & & 黏球藻属(Gloeocapsa)u & & 黏杆藻属(Gloeothece)u & & 微囊藻属(Microcystis)u & & 原绿球藻属(Prochlorococcus)u & & 原绿藻属(Prochloron)u & & 聚球藻属(Synechococcus)u & & 集胞藻属(Synechocystis)n & & & 第二目（宽球藻目(Pleurocapsales)）l & & & 第一科u & & (Cyanocystis)u & & (Dermocarpella)u & & (Stanieria)u & & 异球藻属(Xenococcus)l & & & 第二科u & & 拟色球藻属(Chroococcidiopsis)u & & 黏囊藻属(Myxosarcina)u & & 宽球藻属(Pleurocapsa)n & & & 第三目（颤藻目(Oscillatoriales)l & & & 第一科u & & 节螺藻属(Arthrospira)（包含商业化螺旋藻）u & & (Borzia)u & & (Crinalium)u & & (Geitlerinema)u & & 盐螺旋藻属(Halospirulina)u & & (Leptolyngbya)u & & (Limnothrix)u & & 鞘丝藻属(Lyngbya)u & & 微鞘藻属(Microcoleus)u & & 颤藻属(Oscillatoria)u & & (Planktothrix)u & & 原绿发藻属(Prochlorothrix)u & & (Pseudanabaena)u & & 螺旋藻属(Spirulina)u & & (Starria)u & & 束藻属(Symploca)u & & 束毛藻属(Trichodesmium)u & & (Tychonema)n & & & 第四目（念珠藻目(Nostocales)）l & & & 第一科u & & 鱼腥藻属(Anabaena)u & & 项圈藻属(Anabaenopsis)u & & 束丝藻属(Aphanizomenon)u & & (Cyanospira)u & & (Cylindrospermopsis)u & & 筒孢藻属(Cylindrospermum)u & & 节球藻属(Nodularia)u & & 念珠藻属(Nostoc)u & & 伪枝藻属(Scytonema)l & & & 第二科u & & 眉藻属(Calothrix)u & & 胶须藻属(Rivularia)u & & 单歧藻属(Tolypothrix)n & & & 第五目（真枝藻目(Stigonematales)）l & & & 第一科u & & (Chlorogloeopsis)u & & 费氏藻属(Fischerella)u & & (Geitleria)u & & (Iyengariella)u & & 拟念珠藻属(Nostochopsis)u & & 真枝藻属(Stigonema)l & & 脱铁杆菌门(Deferribacteres)l & & & 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)n & & & 脱铁杆菌目(Deferribacterales)l & & & 脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)u & & 脱铁杆菌属(Deferribacter)u & & (Denitrovibrio)u & & (Flexistipes)u & & 地弧菌属(Geovibrio)u & & (Mucispirillum)l & & & 科未定u & & 暖发菌属(Caldithrix)u & & (Synergistes)l & & 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)l & & & 异常球菌纲(Deinococci)n & & & 异常球菌目(Deinococcales)l & & & 异常球菌科(Deinococcaceae)u & & 异常杆菌属(Deinobacter)u & & 异常球菌属(Deinococcus)l & & & 特吕珀菌科(Trueperaceae)u & & 特吕珀菌属(Truepera)n & & & 栖热菌目(Thermales)l & & & 栖热菌科(Thermaceae)u & & 海栖热菌属(Marinithermus)u & & 亚栖热菌属(Meiothermus)u & & 海洋栖热菌属(Oceanithermus)u & & 栖热菌属(Thermus)u & & 火山栖热菌属(Vulcanithermus)l & & 网团菌门(Dictyoglomi)l & & & 网团菌纲(Dictyoglomi)n & & & 网团菌目(Dictyoglomales)l & & & 网团菌科(Dictyoglomaceae)u & & 网团菌属(Dictyoglomus)l & & 纤维杆菌门(Fibrobacteres)l & & & 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)n & & & 纤维杆菌目(Fibrobacterales)l & & & 纤维杆菌科(Fibrobacteraceae)u & & 纤维杆菌属(Fibrobacter)l & & 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）l & & & 芽孢杆菌纲(Bacilli)n & & & 芽孢杆菌目(Bacillales)l & & & (Alicyclobacillaceae)u & & (Alicyclobacillus)u & & (Pasteuria)u & & (Sulfobacillus)l & & & 芽孢杆菌科(Bacillaceae)u & & (Alkalibacillus)u & & (Amphibacillus)u & & (Anoxybacillus)u & & 芽孢杆菌属(Bacillus)u & & (Caldalkalibacillus)u & & (Cerasibacillus)u & & (Exiguobacterium)u & & (Filobacillus)u & & (Geobacillus)u & & (Gracilibacillus)u & & (Halalkalibacillus)u & & (Halobacillus)u & & (Haloactibacillus)u & & (Jeotgalibacillus)u & & (Lentibacillus)u & & (Lysinibacillus)u & & (Marinibacillus)u & & (Oceanobacillus)u & & (Ornithinibacillus)u & & (Paraliobacillus)u & & (Paucisalibacillus)u & & (Pelagibacillus)u & & (Piscibacillus)u & & (Pontibacillus)u & & 糖球菌属(Saccharococcus)u & & (Salibacillus)u & & (Salimicrobium)u & & (Salinibacillus)u & & (Salirhabdus)u & & (Sasuginibacillus)u & & (Tenuibacillus)u & & (Terribacillus)u & & (Thalassobacillus)u & & (Ureibacillus)u & & (Virgibacillus)u & & (Vulcanibacillus)l & & & (Caryophanaceae)u & & (Caryophanon)l & & & 李斯特氏菌科(Listeriaceae)u & & 环丝菌属(Brochothrix)u & & 李斯特氏菌属(Listeria)l & & & (Paenibacillaceae)u & & (Ammoniphilus)u & & (Aneurinibacillus)u & & (Brevibacillus)u & & (Cohnella)u & & (Oxalophagus)u & & (Paenibacillus)u & & (Thermicanus)u & & (Thermobacillus)l & & & (Planococcaceae)u & & (Filibacter)u & & (Kurthia)u & & (Planococcus)u & & (Planomicrobium)u & & (Sporosarcina)l & & & 芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)u & & (Marinococcus)u & & (Sinococcus)u & & 芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus)u & & (Tuberibacillus)l & & & 葡萄球菌科(Staphylococcaceae)u & & 孪生菌属(Gemella)u & & (Joetgalicoccus)u & & (Macrococcus)u & & (Salinicoccus)u & & 葡萄球菌属(Staphylococcus)l & & & (Thermoactinomycetaceae)u & & (Laceyella)u & & (Mechercharimyces)u & & (Planifilum)u & & (Seinonella)u & & (Shimazuella)u & & (Thermoactinomyces)u & & (Thermoflavimicrobium)l & & & (Turicibacteraceae)u & & (Turicibacter)l & & & 科未定u & & (Pullulanibacillus)n & & & 乳杆菌目(Lactobacillales)l & & & 气球菌科(Aerococcaceae)u & & (Abiotrophia)u & & 气球菌属(Aerococcus)u & & (Dolosicoccus)u & & (Eremococcus)u & & (Facklamia)u & & (Globicatella)u & & (Ignavigranum)l & & & 肉杆菌科(Carnobacteriaceae)u & & (Agitococcus)u & & (Alkalibacterium)u & & (Allofustis)u & & (Alloiococcus)u & & (Atopococcus)u & & (Atopostipes)u & & 肉杆菌属(Carnobacterium)u & & 德库菌属(Desemzia)（DSMZ，德国微生物与细胞保藏中心）u & & (Dolosigranulum)u & & (Granulicatella)u & & (Isobaculum)u & & (Lactosphaera)u & & (Marinilactibacillus)u & & (Trichococcus)l & & & 肠球菌科(Enterococcaceae)u & & (Atopobacter)u & & (Catellicoccus)u & & 肠球菌属(Enterococcus)u & & (Melissococcus)u & & (Pilibacter)u & & (Tetragenococcus)u & & 漫游球菌属(Vagococcus)l & & & 乳杆菌科(Lactobacillaceae)u & & 乳杆菌属(Lactobacillus)u & & (Paralactobacillus)u & & 片球菌属(Pediococcus)l & & & 明串珠菌科(Leuconostocaceae)u & & 明串珠菌属(Leuconostoc)u & & (Oenococcus)u & & (Weissella)l & & & 颤螺旋菌科(Oscillospiraceae)u & & 颤杆菌克(Oscillibacter)u & & 颤螺旋菌属(Oscillospira)l & & & 链球菌科(Streptococcaceae)u & & 乳球菌属(Lactococcus)u & & (Lactovum)u & & 链球菌属(Streptococcus)l & & & 科未定u & & (Acetoanaerobium)u & & 互营球菌属(Syntrophococcus)l & & & 梭菌纲(Clostridia)n & & & 梭菌目(Clostridiales)l & & & 梭菌科(Clostridiaceae)u & & (Acetanaerobacterium)u & & (Acetivibrio)u & & (Acidaminobacter)u & & (Alkaliphilus)u & & (Anaerobacter)u & & (Anaerotruncus)u & & (Anoxynatronum)u & & (Bryantella)u & & (Caloramator)u & & (Caloranaerobacter)u & & (Caminicella)u & & (Clostridiisalibacter)u & & 梭菌属(Clostridium)u & & (Coprobacillus)u & & (Dorea)u & & (Ethanoligenens)u & & (Faecalibacterium)u & & (Fastidiosipila)u & & (Garciella)u & & (Gracilibacter)u & & (Guggenheimella)u & & (Hespellia)u & & (Natronincola)u & & (Oxobacter)u & & (Parasporobacterium)u & & 八叠球菌属(Sarcina)u & & (Soehngenia)u & & (Sporacetigenium)u & & (Sporobacter)u & & (Subdoligranulum)u & & (Tepidibacter)u & & (Tepidimicrobium)u & & (Thermobrachium)u & & (Thermohalobacter)u & & (Tindallia)l & & & 优杆菌科(Eubacteriaceae)u & & 醋杆菌属(Acetobacterium)u & & (Alkalibacter)u & & (Anaerofustis)u & & (Anaerovorax)u & & 优杆菌属(Eubacterium)u & & (Mogibacterium)u & & (Pseudoramibacter)l & & & 太阳杆菌科(Heliobacteriaceae)u & & 太阳杆状菌属(Heliobacillus)u & & 太阳杆菌属(Heliobacterium)u & & 嗜日菌属(Heliophilum)u & & (Heliorestis)l & & & 毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)u & & (Acetitomaculum)u & & (Anaerofilum)u & & (Anaerostipes)u & & 丁酸弧菌属(Butyrivibrio)u & & (Catenibacterium)u & & (Catonella)u & & 粪球菌属(Coprococcus)u & & (Johnsonella)u & & (Lachnobacterium)u & & 毛螺旋菌属(Lachnospira)u & & (Moryella)u & & (Oribacterium)u & & 假丁酸弧菌属(Pseudobutyrivibrio)u & & (Roseburia)u & & 瘤胃球菌属(Ruminococcus)u & & (Shuttleworthia)u & & (Sporobacterium)l & & & 消化球菌科(Peptococcaceae)u & & (Carboxydothermus)u & & (Cryptanaerobacter)u & & (Dehalobacter)u & & (Desulfitobacterium)u & & (Desulfonispora)u & & (Desulfosporosinus)u & & (Desulfotomaculum)u & & (Pelotomaculum)u & & 消化球菌属(Peptococcus)u & & (Syntrophobotulus)u & & (Thermincola)u & & (Thermoterrabacterium)l & & & 消化链球菌科(Peptostreptococcaceae)u & & (Anaerococcus)u & & (Filifactor)u & & (Finegoldia)u & & (Fusibacter)u & & (Gallicola)u & & (Helcococcus)u & & 微单胞菌属(Parvimonas) （原名Micromonas）u & & (Peptoniphilus)u & & 消化链球菌属(Peptostreptococcus)u & & (Sedimentibacter)u & & (Sporanaerobacter)u & & (Tissierella)l & & & 互营单胞菌科(Syntrophomonadaceae)u & & (Aminiphilus)u & & (Aminobacterium)u & & (Aminomonas)u & & (Anaerobaculum)u & & (Anaerobranca)u & & (Caldicellulosiruptor)u & & (Carboxydocella)u & & (Dethiosulfovibrio)u & & (Pelospora)u & & 互营单胞菌属(Syntrophomonas)u & & (Syntrophospora)u & & 互营热菌属(Syntrophothermus)u & & (Thermaerobacter)u & & (Thermanaerovibrio)u & & (Thermohydrogenium)u & & (Thermosyntropha)u & & (Thermovirga)l & & & 韦荣氏菌科(Veillonellaceae)u & & (Acetonema)u & & 氨基酸球菌属(Acidaminococcus)u & & (Allisonella)u & & (Anaeroarcus)u & & (Anaeroglobus)u & & (Anaeromusa)u & & (Anaerosinus)u & & (Anaerovibrio)u & & (Centipeda)u & & (Dendrosporobacter)u & & (Dialister)u & & (Megamonas)u & & (Megasphaera)u & & 光冈菌属(Mitsuokella)u & & (Papillibacter)u & & (Pectinatus)u & & (Pelosinus)u & & (Phascolarctobacterium)u & & (Propionispira)u & & (Propionispora)u & & (Quinella)u & & (Schwartzia)u & & 新月形单胞菌属(Selenomonas)u & & 鼠孢菌属(Sporomusa)u & & (Sporotalea)u & & (Succiniclasticum)u & & (Succinispira)u & & (Thermosinus)u & & 韦荣氏菌属(Veillonella)u & & (Zymophilus)l & & & 科未定u & & (Anaerovirgula)u & & (Dethiosulfatibacter)u & & (Geosporobacter)u & & (Howardella)u & & (Proteiniborus)n & & & 盐厌氧菌目(Halanaerobiales)l & & & 盐厌氧菌科(Halanaerobiaceae)u & & 盐厌氧菌属(Halanaerobium)u & & (Halocella)u & & (Haloincola)u & & (Halothermothrix)l & & & 盐拟杆菌科(Halobacteroidaceae)u & & (Acetohalobium)u & & (Halanaerobacter)u & & 盐拟杆菌属(Halobacteroides)u & & (Halonatronum)u & & (Natroniella)u & & (Orenia)u & & (Selenihalanaerobacter)u & & (Sporohalobacter)n & & & 盐碱厌氧菌目(Natranaerobiales)l & & & 盐碱厌氧菌科(Natranaerobiaceae)u & & 盐碱厌氧菌属(Natranaerobius)n & & & 热厌氧杆菌目(Thermoanaerobacteriales)l & & & 热厌氧杆菌科(Thermoanaerobacteriaceae)u & & (Acetogenium)u & & (Ammonifex)u & & (Caldanaerobacter)u & & (Carboxydibrachium)u & & (Coprothermobacter)u & & (Desulfovirgula)u & & (Gelria)u & & (Mahella)u & & (Moorella)u & & (Sporotomaculum)u & & (Tepidanaerobacter)u & & (Thermacetogenium)u & & 热厌氧单胞菌属(Thermanaeromonas)u & & (Thermoanaerobacter)u & & (Thermoanaerobium)u & & (Thermoanaerobacterium)u & & 热厌氧菌属(Thermoanaerobium)u & & (Thermobacteroides)u & & (Thermosediminibacter)u & & (Thermovenabulum)l & & & 热脱硫菌科(Thermodesulfobiaceae)u & & 热脱硫菌属(Thermodesulfobium)n & & & 目未定l & & & (Desulfitibacter)l & & & (Symbiobacterium)l & & & 热石杆菌纲(Thermolithobacteria)n & & & 热石杆菌目(Thermolithobacterales)l & & & 热石杆菌科(Thermolithobacteraceae)l & & 梭杆菌门(Fusobacteria)l & & & 梭杆菌纲(Fusobacteria)n & & & 梭杆菌目(Fusobacteriales)l & & & 梭杆菌科(Fusobacteriaceae)u & & 梭杆菌属(Fusobacterium)u & & (Ilyobacter)u & & 纤毛菌属(Leptotrichia)u & & (Propionigenium)u & & (Sebaldella)u & & (Sneathia)u & & (Streptobacillus)l & & & 科未定u & & (Cetobacterium)l & & 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)l & & & 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes)n & & & 芽单胞菌目(Gemmatimonadales)l & & & 芽单胞菌科(Gemmatimonadaceae)u & & 芽单胞菌属(Gemmatimonas)l & & 黏胶球形菌门(Lentisphaerae)l & & & 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae)n & & & 黏胶球形菌目(Lentisphaerales)l & & & 黏胶球形菌科(Lentisphaeraceae)u & & 黏胶球形菌属(Lentisphaera)n & & & 食物谷菌目(Victivallales)l & & & 食物谷菌科(Victivallaceae)u & & 食物谷菌属(Victivallis)l & & 硝化螺旋菌门(Nitrospirae)l & & & 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)n & & & 硝化螺旋菌目(Nitrospirales)l & & & 硝化螺旋菌科(Nitrospiraceae)u & & 钩端螺菌属(Leptospirillum)u & & 硝化螺旋菌属(Nitrospira)u & & 磁杆菌属(Magnetobacterium)*u & & 热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio)l & & 浮霉菌门(Planctomycetes)l & & & 浮霉菌纲(Planctomycetacia)n & & & 浮霉菌目(Planctomycetales)l & & & 浮霉菌科(Planctomycetaceae)u & & (Blastopirellula)u & & (Gemmata)u & & (Isosphaera)u & & 小梨形菌属(Pirellula)u & & 浮霉菌属(Planctomycetes)u & & 红小梨形菌属(Rhodopirellula)u & & (Schlesneria)l & & & 科未定 （均未能分离培养，见厌氧氨氧化菌）u & & (Brocadia)*u & & (Kuenenia)*u & & (Scalindua)*l & & 海绵杆菌门(Poribacteria)*l & & 变形菌门(Proteobacteria)l & & & α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)n & & & 柄杆菌目(Caulobacterales)l & & & 柄杆菌科(Caulobacteraceae)u & & (Asticcacaulis)u & & 短波单胞菌属(Brevundimonas)u & & 柄杆菌属(Caulobacter)u & & 苯基杆菌属(Phenylobacterium)n & & & (Kordiimonadales)l & & & (Kordiimonadaceae)u & & (Kordiimonas)n & & & 短小盒菌目(Parvularculales)l & & & 短小盒菌科(Parvularculaceae)u & & 短小盒菌属(Parvularcula)n & & & 根瘤菌目(Rhizobiales)l & & & 橙单胞菌科(Aurantimonadaceae)u & & 橙单胞菌属(Aurantimonas)u & & (Fulvimarina)u & & (Martelella)l & & & 巴通体科(Bartonellaceae)u & & 巴通体属(Bartonella)u & & (Grahamella)u & & (Rochalimaea)l & & & 拜叶林克氏菌科(Beijerinckiaceae)u & & 拜叶林克氏菌属(Beijerinckia)u & & (Chelatococcus)u & & (Methylocapsa)u & & (Methylocella)l & & & 慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)u & & 阿菲波菌属(Afipia)u & & 农单胞菌属(Agromonas)u & & (Balneimonas)u & & 芽生杆菌属(Blastobacter)u & & (Bosea)u & & 慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)u & & 硝化杆菌属(Nitrobacter)u & & (Oligotropha)u & & (Rhodoblastus)u & & 红假单胞菌属(Rhodopseudomonas)l & & & 布鲁氏菌科(Brucellaceae)u & & 布鲁氏菌属(Brucella)u & & (Crabtreella)u & & (Daeguia)u & & 支动菌属(Mycoplana)u & & 苍白杆菌属(Ochrobactrum)u & & (Pseudochrobactrum)l & & & 黏着杆菌科(Cohaesibacteraceae)u & & 黏着杆菌属(Cohaesibacter)l & & & 生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)u & & (Ancalomicrobium)u & & (Angulomicrobium)u & & 水杆菌属(Aquabacter)u & & 芽绿菌属(Blastochloris)u & & (Devosia)u & & (Dichotomicrobium)u & & (Filomicrobium)u & & (Gemmiger)u & & 生丝微菌属(Hyphomicrobium)u & & (Methylorhabdus)u & & 土微菌属(Pedomicrobium)u & & 突柄微菌属(Prosthecomicrobium)u & & 红微菌属(Rhodomicrobium)u & & (Rhodoplanes)u & & (Seliberia)l & & & 甲基杆菌科(Methylobacteriaceae)u & & (Meganema)u & & 甲基杆菌属(Methylobacterium)u & & (Microvirga)u & & (Protomonas)l & & & 甲基孢囊菌科(Methylocystaceae)u & & (Albibacter)u & & 甲基孢囊菌属(Methylocystis)u & & (Methylopila)u & & (Methylosinus)u & & (Pleomorphomonas)u & & (Terasakiella)l & & & 叶杆菌科(Phyllobacteriaceae)u & & (Aminobacter)u & & (Aquamicrobium)u & & (Defluvibacter)u & & (Hoeflea)u & & 中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)u & & (Nitratireductor)u & & 叶杆菌属(Phyllobacterium)u & & (Pseudaminobacter)l & & & 根瘤菌科(Rhizobiaceae)u & & 土壤杆菌属(Agrobacterium)u & & 异根瘤菌属(Allorhizobium)u & & 嗜碳菌属(Carbophilus)u & & 螯合杆菌属(Chelatobacter)u & & 剑菌属(Ensifer)u & & (Kaistia)u & & 韧皮杆菌属(Liberibacter)*u & & 根瘤菌属(Rhizobium)u & & 中华根瘤菌属(Sinorhizobium)l & & & 红菌科(Rhodobiaceae)u & & (Anderseniella)u & & (Parvibaculum)u & & 红菌属(Rhodobium)u & & 玫瑰螺菌属(Roseospirillum)l & & & 黄色杆菌科(Xanthobacteraceae)u & & (Ancylobacter)u & & (Azorhizobium)u & & (Labrys)u & & (Pseudolabrys)u & & (Starkeya)u & & 黄色杆菌属(Xanthobacter)l & & & 科未定u & & (Sneathiella)n & & & 红杆菌目(Rhodobacterales)l & & & 生丝单胞菌科(Hyphomonadaceae)u & & (Hirschia)u & & 生丝单胞菌属(Hyphomonas)u & & (Maricaulis)u & & (Oceanicaulis)u & & (Robiginitomaculum)l & & & 红杆菌科(Rhodobacteraceae)u & & (Ahrensia)u & & (Albidovulum)u & & (Amaricoccus)u & & (Antarctobacter)u & & (Catellibacterium)u & & (Citreicella)u & & (Citreimonas)u & & (Dinoroseobacter)u & & (Donghicola)u & & (Gemmobacter)u & & (Haematobacter)u & & (Jannaschia)u & & (Ketogulonicigenium)u & & (Labrenzia)u & & (Leisingera)u & & (Loktanella)u & & (Maribius)u & & (Marinovum)u & & (Maritimibacter)u & & (Methylarcula)u & & (Nereida)u & & (Nesiotobacter)u & & (Oceanibulbus)u & & 海洋生菌属(Oceanicola)u & & (Octadecabacter)u & & (Palleronia)u & & (Pannonibacter)u & & 副球菌属(Paracoccus)u & & (Pelagibaca)u & & (Phaeobacter)u & & 假红杆菌属(Pseudorhodobacter)u & & (Pseudovibrio)u & & (Rhodobaca)u & & 红杆菌属(Rhodobacter)u & & (Rhodothalassium)u & & 小红卵菌属(Rhodovulum)u & & (Roseibacterium)u & & (Roseibium)u & & (Roseicyclus)u & & (Roseinatronobacter)u & & (Roseisalinus)u & & (Roseivivax)u & & 玫瑰杆菌属(Roseobacter)u & & (Roseovarius)u & & (Rubellimicrobium)u & & (Rubrimonas)u & & (Ruegeria)u & & (Sagittula)u & & (Salipiger)u & & (Shimia)u & & (Silicibacter)u & & (Staleya)u & & (Stappia)u & & (Sulfitobacter)u & & (Tateyamaria)u & & (Thalassobacter)u & & (Thalassobius)u & & (Thalassococcus)u & & (Thioclava)u & & 硫球形菌属(Thiosphaera)u & & (Wenxinia)u & & 木洞菌属(Woodsholea)u & & 杨氏菌属(Yangia)n & & & 红螺菌目(Rhodospirillales)l & & & 醋杆菌科(Acetobacteraceae)u & & 醋杆菌属(Acetobacter)u & & (Acidicaldus)u & & 嗜酸菌属(Acidiphilium)u & & 酸球形菌属(Acidisphaera)u & & 酸胞菌属(Acidocella)u & & 酸单胞菌属(Acidomonas)u & & (Asaia)u & & (Belnapia)u & & 脆弱球菌属(Craurococcus)u & & 葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter)u & & 葡糖杆菌属(Gluconobacter)u & & (Granulibacter)u & & (Kozakia)u & & 鼠球菌属(Muricoccus)u & & (Neoasaia)u & & (Paracraurococcus)u & & 红球状菌属(Rhodopila)u & & (Rhodovarius)u & & 玫瑰球菌属(Roseococcus)u & & 玫瑰单胞菌属(Roseomonas)u & & (Rubritepida)u & & (Saccharibacter)u & & (Stella)u & & (Swaminathania)u & & (Teichococcus)u & & (Zavarzinia)l & & & 红螺菌科(Rhodospirillaceae)u & & 固氮螺菌属(Azospirillum)u & & (Conglomeromonas)u & & (Defluviicoccus)u & & (Inquilinus)u & & 磁螺菌属(Magnetospirillum)u & & (Phaeospirillum)u & & (Rhodocista)u & & 红螺旋菌属(Rhodospira)u & & 红螺菌属(Rhodospirillum)u & & 红弧菌属(Rhodovibrio)u & & 玫瑰螺旋菌属(Roseospira)u & & (Skermanella)u & & (Telmatospirillum)u & & (Thalassospira)u & & (Tistrella)n & & & 立克次体目(Rickettsiales)l & & & 无形体科(Anaplasmataceae)u & & (Aegyptianella)u & & 无形体属(Anaplasma)u & & (Cowdria)u & & 埃里希体属(Ehrlichia)u & & 新立克次体属(Neorickettsia)u & & 沃巴赫体属(Wolbachia)u & & (Xenohaliotis)*l & & & 全孢菌科(Holosporaceae)u & & 全孢菌属(Holospora)l & & & 立克次体科(Rickettsiaceae)u & & (Orientia)u & & 立克次体属(Rickettsia)l & & & SAR 11群*u & & 远洋杆菌属(Pelagibacter)*l & & & 科未定u & & (Lyticum)u & & (Odyssella)*u & & (Pseudocaedibacter)u & & (Symbiotes)u & & (Tectibacter)n & & & 鞘脂单胞菌目(Sphingomonadales)l & & & 赤杆菌科(Erythrobacteraceae)u & & (Altererythrobacter)u & & 赤杆菌属(Erythrobacter)u & & 赤微菌属(Erythromicrobium)u & & 紫杆菌属(Porphyrobacter)l & & & 鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae)u & & 芽单胞菌属(Blastomonas)u & & 柠檬酸微菌属(Citromicrobium)*u & & 赤单胞菌属(Erythromonas)u & & 新鞘脂菌属(Novosphingobium)u & & (Sandaracinobacter)u & & (Sandaracinorhabdus）u & & 鞘脂菌属(Sphingobium)u & & 鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)u & & (Sphingopyxis)u & & (Sphingosinicella)u & & 发酵单胞菌属(Zymomonas)n & & & 目未定l & & & (Albimonas)l & & & (Caenispirillum)l & & & (Insolitispirillum)l & & & (Novispirillum)l & & & β-变形菌纲(Betaproteobacteria)n & & & 伯克氏菌目(Burkholderiales)l & & & 产碱菌科(Alcaligenaceae)u & & 无色杆菌属(Achromobacter)u & & (Advenella)u & & 产碱菌属(Alcaligenes)u & & (Azohydromonas)u & & 博德氏菌属(Bordetella)u & & (Brackiella)u & & (Castellaniela)u & & 德克斯氏菌属(Derxia)u & & (Kerstersia)u & & (Oligella)u & & (Pelistega)u & & (Pigmentiphaga)u & & (Pusillimonas)u & & (Sutterella)u & & (Taylorella)u & & (Tetrathiobacter)l & & & 伯克氏菌科(Burkholderiaceae)u & & 伯克氏菌属(Burkholderia)u & & (Chitinimonas)u & & (Cupriavidus)u & & (Lautropia)u & & (Limnobacter)u & & (Pandoraea)u & & (Paucimonas)u & & (Polynucleobacter)u & & 青枯菌属(Ralstonia)u & & (Thermothrix)u & & 沃特氏菌属(Wautersia)l & & & 丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)u & & 食酸菌属(Acidovorax)u & & (Alcycliphilus)u & & (Brachymonas)u & & (Caenibacterium)u & & (Caldimonas)u & & 丛毛单胞菌属(Comamonas)u & & (Curvibacter)u & & 代尔夫特菌属(Delftia)u & & (Diaphorobacter)u & & (Giesbergeria)u & & 噬氢菌属(Hydrogenophaga)u & & (Hylemonella)u & & (Lampropedia)u & & (Macromonas)u & & (Malikia)u & & (Ottowia)u & & (Pelomonas)u & & (Polaromonas)u & & (Ramlibacter)u & & 红育菌属(Rhodoferax)u & & (Schlegelella)u & & (Simplicispira)u & & 贪食菌属(Variovorax)u & & (Xenophilus)l & & & 草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)u & & (Collimonas)u & & (Duganella)u & & (Herbaspirillum)u & & (Herminiimonas)u & & (Janthinobacterium)u & & (Massilia)u & & (Naxibacter)u & & (Oxalicibacterium)u & & 草酸杆菌属(Oxalobacter)u & & (Telluria)u & & (Undibacterium)l & & & 科未定u & & (Aquabacterium)u & & (Aquincola)u & & (Ideonella)u & & 纤发菌属(Leptothrix)u & & (Methylibium)u & & (Mitsuaria)u & & (Paucibacter)u & & (Roseateles)u & & 红长命菌属(Rubrivivax)u & & (Sphaerotilus)u & & (Tepidicella)u & & (Tepidimonas)u & & (Thiobacter)u & & 硫单胞菌属(Thiomonas)u & & (Xylophilus)n & & & 嗜氢菌目(Hydrogenophilales)l & & & 嗜氢菌科(Hydrogenophilaceae)u & & 嗜氢菌属(Hydrogenophilus)u & & (Petrobacter)u & & (Tepidiphilus)u & & 硫杆状菌属(Thiobacillus)n & & & 嗜甲基菌目(Methylophilales)l & & & 嗜甲基菌科(Methylophilaceae)u & & (Methylobacillus)u & & 嗜甲基菌属(Methylophilus)u & & (Methylotenera)u & & (Methylovorus)n & & & 奈瑟菌目(Neisseriales)l & & & 奈瑟菌科(Neisseriaceae)u & & (Alysiella)u & & (Andreprevotia)u & & 水螺菌属(Aquaspirillum)u & & (Aquitalea)u & & (Bergeriella)u & & (Chitinibacter)u & & (Chitinilyticum)u & & 色杆菌属(Chromobacterium)u & & (Conchiformibius)u & & (Deefgea)u & & 艾肯氏菌属(Eikenella)u & & (Formivibrio)u & & (Gulbenkiania)u & & (Iodobacter)u & & 金氏菌属(Kingella)u & & 鸥杆菌属(Laribacter)u & & (Leeia)u & & (Microvirgula)u & & (Morococcus)u & & 奈瑟菌属(Neisseria)u & & (Paludibacterium)u & & (Prolinoborus)u & & (Silvimonas)u & & (Simonsiella)u & & (Uruburuella)u & & (Vitreoscilla)u & & (Vogesella)n & & & 亚硝化单胞菌目(Nitrosomonadales)l & & & 嘉利翁氏菌科(Gallionellaceae)u & & 嘉利翁氏菌属(Gallionella)l & & & 亚硝化单胞菌科(Nitrosomonadaceae)u & & 亚硝化叶菌属(Nitrosolobus)u & & 亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)u & & 亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)l & & & 螺菌科(Spirillaceae)u & & 螺菌属(Spirillum)n & & & 普罗卡杆菌目(Procabacteriales)*l & & & 普罗卡杆菌科(Procabacteriaceae)*u & & 普罗卡杆菌属(Procabacter)*n & & & 红环菌目(Rhodocyclales)l & & & 红环菌科(Rhodocyclaceae)u & & 固氮弓菌属(Azoarcus)u & & (Azonexus)u & & (Azospira)u & & (Azovibrio)u & & (Dechloromonas)u & & (Dechlorosoma)u & & (Denitratisoma)u & & (Ferribacterium)u & & (Methyloversatilis)u & & 丙酸杆菌属(Propionibacter)u & & (Propionivibrio)u & & (Quatrionicoccus)u & & 红环菌属(Rhodocyclus)u & & (Shinella)u & & (Sterolibacterium)u & & 陶厄氏菌属(Thauera)u & & (Uliginosibacterium)u & & 动胶菌属(Zoogloea)l & & & δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)n & & & 蛭弧菌目(Bdellovibrionales)l & & & (Bacteriovoracaceae)u & & (Bacteriovorax)u & & (Peredibacter)l & & & 蛭弧菌科(Bdellovibrionaceae)u & & 蛭弧菌属(Bdellovibrio)u & & (Micavibrio)u & & (Vampirovibrio)n & & & 脱硫盒菌目(Desulfarculales)l & & & 脱硫盒菌科(Desulfarculaceae)u & & 脱硫盒菌属(Desulfarculus)n & & & 脱硫杆菌目(Desulfobacterales)l & & & 脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae)u & & (Desulfatibacillum)u & & (Desulfatiferula)u & & (Desulfatirhabdium)u & & 脱硫杆菌属(Desulfobacter)u & & (Desulfobacterium)u & & (Desulfobacula)u & & (Desulfobotulus)*u & & (Desulfocella)u & & (Desulfococcus)u & & (Desulfofaba)u & & (Desulfofrigus)u & & (Desulfomusa)u & & (Desulfonema)u & & (Desulforegula)u & & (Desulfosarcina)u & & (Desulfospira)u & & (Desulfotignum)l & & & (Desulfobulbaceae)u & & (Desulfobulbus)u & & (Desulfocapsa)u & & (Desulfofustis)u & & (Desulfopila)u & & (Desulforhopalus)u & & (Desulfotalea)l & & & (Nitrospinaceae)u & & (Nitrospina)n & & & 脱硫弧菌目(Desulfovibrionales)l & & & (Desulfohalobiaceae)u & & (Desulfohalobium)u & & (Desulfonatronovibrio)u & & (Desulfonauticus)u & & (Desulfothermus)u & & (Desulfovermiculus)l & & & (Desulfomicrobiaceae)u & & (Desulfomicrobium)l & & & (Desulfonatronaceae)u & & (Desulfonatronum)l & & & 脱硫弧菌科(Desulfovibrionaceae)u & & (Bilophila)u & & (Desulfomonas)u & & 脱硫弧菌属(Desulfovibrio)u & & (Lawsonia)n & & & 硫还原菌目(Desulfurellales)l & & & 硫还原菌科(Desulfurellaceae)u & & 硫还原菌属(Desulfurella)u & & (Hippea)n & & & 除硫单胞菌目(Desulfuromonadales)l & & & 除硫单胞菌科(Desulfuromonadaceae)u & & 除硫单胞菌属(Desulfuromonas)u & & (Desulfuromusa)u & & (Malonomonas)u & & (Pelobacter)l & & & 地杆菌科(Geobacteraceae)u & & (Geoalkalibacter)u & & 地杆菌属(Geobacter)u & & (Geopsychrobacter)u & & (Geothermobacter)u & & (Trichlorobacter)n & & & 黏球菌目(Myxococcales)l & & & 孢囊杆菌亚目(Cystobacterineae)u & & 孢囊杆菌科(Cystobacteraceae)l & & & (Anaeromyxobacter)l & & & (Archangium)l & & & 孢囊杆菌属(Cystobacter)l & & & (Hyalangium)l & & & (Melittangium)l & & & (Stigmatella)u & & 黏球菌科(Myxococcaceae)l & & & (Angiococcus)l & & & (Corallococcus)l & & & 黏球菌属(Myxococcus)l & & & (Pyxidicoccus)l & & & 侏囊菌亚目(Nannocystineae)u & & (Haliangiaceae)l & & & (Haliangium)u & & (Kofleriaceae)l & & & (Kofleria)u & & 侏囊菌科(Nannocystaceae)l & & & (Enhygromyxa)l & & & 侏囊菌属(Nannocystis)l & & & (Plesiocystis)l & & & 堆囊菌亚目(Sorangineae)u & & 多囊菌科(Polyangiaceae)l & & & (Byssovorax)l & & & (Chondromyces)l & & & (Haploangium)*l & & & (Jahnella)l & & & 多囊菌属(Polyangium)l & & & 堆囊菌属(Sorangium)n & & & 互营杆菌目(Syntrophobacterales)l & & & 互营菌科(Syntrophaceae)u & & (Desulfobacca)u & & (Desulfomonile)u & & (Smithella)u & & 互营菌属(Syntrophus)l & & & 互营杆菌科(Syntrophobacteraceae)u & & (Desulfacinum)u & & (Desulfoglaeba)u & & (Desulforhabdus)u & & (Desulfovirga)u & & 互营杆菌属(Syntrophobacter)u & & (Thermodesulforhabdus)l & & & ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)n & & & 弯曲菌目(Campylobacterales)l & & & 弯曲菌科(Campylobacteraceae)u & & 弓形杆菌属(Arcobacter)u & & 弯曲菌属(Campylobacter)u & & (Dehalospirillum)u & & 硫磺单胞菌属(Sulfurospirillum)l & & & 螺杆菌科(Helicobacteraceae)u & & 螺杆菌属(Helicobacter)u & & (Sulfuricurvum)u & & (Sulfurimonas)u & & (Sulfurovum)u & & (Thiovulum)u & & 沃林氏菌属(Wolinella)l & & & 氢单胞菌科(Hydrogenimonadaceae)u & & 氢单胞菌属(Hydrogenimonas)n & & & (Nautiliales)l & & & (Nautiliaceae)u & & (Caminibacter)u & & (Lebetimonas)u & & (Nautilia)u & & (Nitratifractor)u & & (Nitratiruptor)u & & (Thioreductor)l & & & γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)n & & & 酸硫杆状菌目(Acidithiobacillales)l & & & 酸硫杆状菌科(Acidithiobacillaceae)u & & 酸硫杆状菌属(Acidithiobacillus)l & & & 热硫杆状菌科(Thermithiobacillaceae)u & & 热硫杆状菌属(Thermithiobacillus)n & & & 气单胞菌目(Aeromonadales)l & & & 气单胞菌科(Aeromonadaceae)u & & 气单胞菌属(Aeromonas)u & & (Oceanimonas)u & & (Oceanisphaera)u & & (Tolumonas)u & & (Zobellella)l & & & 琥珀酸弧菌科(Succinivibrionaceae)u & & 厌氧螺菌属(Anaerobiospirillum)u & & 反刍杆菌属(Ruminobacter)u & & 琥珀酸单胞菌属(Succinimonas)u & & 琥珀酸弧菌属(Succinivibrio)n & & & 交替单胞菌目(Alteromonadales)l & & & 交替单胞菌科(Alteromonadaceae)u & & (Aestuariibacter)u & & (Agarivorans)u & & (Alishewanella)u & & 交替单胞菌属(Alteromonas)u & & (Glaciecola)u & & (Marinimicrobium)u & & 海杆菌属(Marinobacter)u & & 海细菌属(Marinobacterium)u & & 产微球茎菌属(Microbulbifer)u & & (Saccharophagus)u & & (Salinimonas)l & & & (Colwelliaceae)u & & (Colwellia)u & & (Thalassomonas)l & & & (Ferrimonadaceae)u & & (Ferrimonas)u & & (Paraferrimonas)l & & & (Idiomarinaceae)u & & (Idiomarina)u & & (Pseudidiomarina)l & & & (Moritellaceae)u & & (Moritella)l & & & 假交替单胞菌科(Pseudoalteromonadaceae)u & & (Algicola)u & & 假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)l & & & 冷单胞菌科(Psychromonadaceae)u & & 冷单胞菌属(Psychromonas)l & & & 希万氏菌科(Shewanellaceae)u & & 希万氏菌属(Shewanella)l & & & 科未定u & & (Teredinibacter)u & & (Endobugula)*n & & & 心杆菌目(Cardiobacteriales)l & & & 心杆菌科(Cardiobacteriaceae)u & & 心杆菌属(Cardiobacterium)u & & (Dichelobacter)u & & (Suttonella)n & & & 着色菌目(Chromatiales)l & & & 着色菌科(Chromatiaceae)u & & (Allochromatium)u & & (Amoebobacter)u & & 着色菌属(Chromatium)u & & 盐着色菌属(Halochromatium)u & & (Isochromatium)u & & (Lamprobacter)u & & (Lamprocystis)u & & (Marichromatium)u & & 亚硝化球菌属(Nitrosococcus)u & & 芬尼氏菌属(Pfennigia)u & & 棍着色菌属(Rhabdochromatium)u & & (Rheinheimera)u & & 热着色菌属(Thermochromatium)u & & 硫碱球菌属(Thioalkalicoccus)u & & 硫橄榄菌属(Thiobaca)u & & 硫匣菌属(Thiocapsa)u & & 硫球菌属(Thiococcus)u & & 硫囊菌属(Thiocystis)u & & 硫网菌属(Thiodictyon)u & & 硫黄球菌属(Thioflavicoccus)u & & 硫盐匣菌属(Thiohalocapsa)u & & (Thiolamprovum)u & & (Thiopedia)u & & 硫红球菌属(Thiorhodococcus)u & & 硫红弧菌属(Thiorhodovibrio)u & & 硫螺菌属(Thiospirillum)l & & & 外硫红螺旋菌科(Ectothiorhodospiraceae)u & & 碱湖生菌属(Alkalilimnicola)u & & 碱螺菌属(Alkalispirillum)u & & (Aquisalimonas)u & & (Arhodomonas)u & & (Ectothiorhodosinus)u & & 外硫红螺旋菌属(Ectothiorhodospira)u & & 盐红螺旋菌属(Halorhodospira)u & & (Natronocella)u & & 硝化球菌属(Nitrococcus)u & & 硫碱螺旋菌属(Thioalkalispira)u & & 硫碱弧菌属(Thialkalivibrio)u & & 硫红螺旋菌属(Thiorhodospira)l & & & 颗粒状球菌科(Granulosicoccaceae)u & & 颗粒状球菌属(Granulosicoccus)l & & & 盐硫杆状菌科(Halothiobacillaceae)u & & 盐硫杆状菌属(Halothiobacillus)u & & (Thiovirga)n & & & 肠杆菌目(Enterobacteriales)l & & & 肠杆菌科(Enterobacteriaceae)u & & (Arsenophonus)u & & (Brenneria)u & & 布赫纳氏菌属(Buchnera)u & & (Budvicia)u & & 布丘氏菌属(Buttiauxella)u & & (Calymmatobacterium)u & & 西地西菌属(Cedecea)u & & 柠檬酸杆菌属(Citrobacter)u & & (Dickeya)u & & 爱德华氏菌属(Edwardsiella)u & & 肠杆菌属(Enterobacter)u & & 欧文氏菌属(Erwinia)u & & 埃希氏菌属(Escherichia) （包含大肠杆菌）u & & (Ewingella)u & & 哈夫尼菌属(Hafnia)u & & 克雷伯氏菌属(Klebsiella)u & & 克吕沃氏菌属(Kluyvera)u & & (Leclercia)u & & (Leminorella)u & & (Levinea)u & & (Moellerella)u & & (Morganella)u & & (Obesumbacterium)u & & 泛菌属(Pantoea)u & & (Pectobacterium)u & & (Phlomobacter)*u & & (Photorhabdus)u & & 邻单胞菌属(Plesiomonas)u & & (Pragia)u & & 变形杆菌属(Proteus) （注：或译作“变形菌属”，此处把“变形菌”一词留给Proteobacteria）u & & 普罗维登斯菌属(Providencia)u & & (Rahnella)u & & (Raoultella)u & & 糖杆菌属(Saccharobacter)u & & 沙门氏菌属(Salmonella)u & & (Samsonia)u & & 沙雷氏菌属(Serratia)u & & 志贺氏菌属(Shigella)u & & (Sodalis)u & & (Tatumella)u & & (Thorsellia)u & & (Trabulsiella)u & & (Wigglesworthia)u & & 致病杆菌属(Xenorhabdus)u & & 耶尔辛氏菌属(Yersinia) （包含鼠疫杆菌）u & & (Yokenella)n & & & 军团菌目(Legionellales)l & & & 柯克斯体科(Coxiellaceae)u & & (Aquicella)u & & 柯克斯体属(Coxiella)u & & 立克次小体属(Rickettsiella)l & & & 军团菌科(Legionellaceae)u & & (Fluoribacter)u & & 军团菌属(Legionella)u & & (Sarcobium)u & & (Tatlockia)n & & & 甲基球菌目(Methylococcales)l & & & 甲基球菌科(Methylococcaceae)u & & 甲基杆菌属(Methylobacter)u & & 甲基暖菌属(Methylocaldum)u & & 甲基球菌属(Methylococcus)u & & 甲基盐菌属(Methylohalobius)u & & 甲基微菌属(Methylomicrobium)u & & 甲基单胞菌属(Methylomonas)u & & 甲基八叠球菌属(Methylosarcina)u & & (Methylosoma)u & & 甲基球形菌属(Methylosphaera)u & & 甲基热菌属(Methylothermus)n & & & 海洋螺菌目(Oceanospirillales)l & & & 食碱菌科(Alcanivoraceae)u & & 食碱菌属(Alcanivorax)u & & (Fundibacter)u & & (Kangiella)l & & & 河氏菌科(Hahellaceae)u & & (Endozoicomonas)u & & 河氏菌属(Hahella)u & & (Halospina)u & & (Zooshikella)l & & & 盐单胞菌科(Halomonadaceae)u & & (Carnimonas)u & & 色盐杆菌属(Chromohalobacter)u & & (Cobetia)u & & (Deleya)u & & 盐单胞菌属(Halomonas)u & & (Halotalea)u & & (Halovibrio)u & & (Modicisalibacter)u & & (Salicola)u & & (Volcaniella)u & & 发酵杆菌属(Zymobacter)l & & & 岸生菌科(Litoricolaceae)u & & 岸生菌属(Litoricola)l & & & 海洋螺菌科(Oceanospirillaceae)u & & (Amphritea)u & & 巴氏发菌属(Balneatrix)u & & 海单胞菌属(Marinomonas)u & & 海螺菌属(Marinospirillum)u & & (Neptuniibacter)u & & (Neptunomonas)u & & (Nitrincola)u & & 海洋杆菌属(Oceanobacter)u & & 海洋螺菌属(Oceanospirillum)u & & 油螺旋菌属(Oleispira)u & & 假螺菌属(Pseudospirillum)u & & (Reinekea)u & & (Thalassolituus)l & & & 嗜油菌科(Oleiphilaceae)u & & 嗜油菌属(Oleiphilus)l & & & 糖螺菌科(Saccharospirillaceae)u & & 糖螺菌属(Saccharospirillum)n & & & 巴斯德氏菌目(Pasteurellales)l & & & 巴斯德氏菌科(Pasteurellaceae)u & & 放线杆菌属(Actinobacillus)u & & (Aggregatibacter)u & & (Avibacterium)u & & (Bibersteinia)u & & (Gallibacterium)u & & 嗜血菌属(Haemophilus)u & & (Histophilus)u & & (Lonepinella)u & & (Mannheimia)u & & (Nicoletella)u & & 巴斯德氏菌属(Pasteurella)u & & (Phocoenobacter)u & & (Volucribacter)n & & & 假单胞菌目(Pseudomonadales)l & & & 莫拉菌科(Moraxellaceae)u & & 不动杆菌属(Acinetobacter)u & & (Alkanindiges)u & & 布兰汉氏菌(Branhamella)u & & (Enhydrobacter)u & & 莫拉菌属(Moraxella)u & & (Perlucidibaca)u & & 冷杆菌属(Psychrobacter)l & & & 假单胞菌科(Pseudomonadaceae)u & & (Azomonas)u & & (Azomonotrichon)u & & (Azorhizophilus)u & & (Azotobacter)u & & 纤维弧菌属(Cellvibrio)u & & (Chryseomonas)u & & (Flavimonas)u & & (Mesophilobacter)u & & 假单胞菌属(Pseudomonas)u & & 根瘤杆菌属(Rhizobacter)u & & 皱纹单胞菌属(Rugamonas)u & & 蛇形菌属(Serpens)n & & & 咸水球形菌目(Salinisphaerales)l & & & 咸水球形菌科(Salinisphaeraceae)u & & 咸水球形菌属(Salinisphaera)n & & & 硫发菌目(Thiotrichales)l & & & (Francisellaceae)u & & (Francisella)l & & & 鱼立克次体科(Piscirickettsiaceae)u & & (Cycloclasticus)u & & (Hydrogenovibrio)u & & (Methylophaga)u & & 鱼立克次体属(Piscirickettsia)u & & (Sulfurivirga)u & & (Thioalkalimicrobium)u & & (Thiomicrospira)l & & & 硫发菌科(Thiotrichaceae)u & & 无色菌属(Achromatium)u & & 贝扎托菌属(Beggiatoa)u & & 亮发菌属(Leucothrix)u & & 硫杆菌属(Thiobacterium)u & & 硫珠菌属(Thiomargarita)u & & 硫辫菌属(Thioploca)u & & 硫螺旋菌属(Thiospira)u & & 硫发菌属(Thiothrix)l & & & 科未定u & & (Caedibacter)u & & (Fangia)n & & & 弧菌目(Vibrionales)l & & & 弧菌科(Vibrionaceae)u & & (Aliivibrio)u & & 异单胞菌属(Allomonas)u & & (Beneckea)u & & 链状球菌属(Catenococcus)u & & 肠弧菌属(Enterovibrio)u & & (Grimontia)u & & (Listonella)u & & (Lucibacterium)u & & 发光杆菌属(Photobacterium)u & & (Salinivibrio)u & & 弧菌属(Vibrio)n & & & 黄色单胞菌目(Xanthomonadales)l & & & 华杆菌科(Sinobacteraceae)u & & (Hydrocarboniphaga)u & & (Nevskia)u & & 华杆菌属(Sinobacter)l & & & 黄色单胞菌科(Xanthomonadaceae)u & & 水单胞菌属(Aquimonas)u & & (Arenimonas)u & & (Aspromonas)u & & (Dokdonella)u & & (Dyella)u & & (Frateuria)u & & (Fulvimonas)u & & (Ignatzschineria)u & & (Luteibacter)u & & (Luteimonas)u & & (Lysobacter)u & & 假黄色单胞菌属(Pseudoxanthomonas)u & & (Rhodanobacter)u & & (Silanimonas)u & & (Stenotrophomonas)u & & 热单胞菌属(Thermomonas)u & & 黄色单胞菌属(Xanthomonas)u & & (Xylella)n & & & 目未定l & & & 碱单胞菌属(Alkalimonas)l & & & (Bowmanella)l & & & 聚集杆菌属(Congregibacter)*l & & & (Methylohalomonas)l & & & (Methylonatrum)l & & & (Sedimenticola)l & & & (Solimonas)l & & & (Thiohalomonas)l & & & (Thiohalophilus)l & & 螺旋体门(Spirochaetes)l & & & 螺旋体纲(Spirochaetes)n & & & 螺旋体目(Spirochaetales)l & & & 短螺旋体科(Brachyspiraceae)u & & 短螺旋体属(Brachyspira)u & & 小蛇菌属(Serpulina)l & & & 钩端螺旋体科(Leptospiraceae)u & & 纤线菌属(Leptonema)u & & 钩端螺旋体属(Leptospira)u & & (Turneriella)l & & & 螺旋体科(Spirochaetaceae)u & & 疏螺旋体属(Borrelia)u & & (Brevinema)u & & (Clevelandina)u & & (Cristispira)u & & (Diplocalyx)u & & (Hollandina)u & & (Pillotina)u & & 螺旋体属(Spirochaeta)u & & 密螺旋体属(Treponema)l & & 柔膜菌门(Tenericutes)l & & & 注：此处Tenericutes不同于原先基于形态分类的“软壁菌门”，而仅包括支原体及其基于分子演化分类的亲属l & & & 柔膜菌纲(Mollicutes)n & & & 无胆甾原体目(Acholeplasmatales)l & & & 无胆甾原体科(Acholeplasmataceae)u & & 无胆甾原体属(Acholeplasma)u & & 植原体属(Phytoplasma)*n & & & 厌氧原体目(Anaeroplasmatales)l & & & 厌氧原体科(Anaeroplasmataceae)u & & 厌氧原体属(Anaeroplasma)u & & 无甾醇原体属(Asteroleplasma)n & & & 虫原体目(Entomoplasmatales)l & & & 虫原体科(Entomoplasmataceae)u & & 虫原体属(Entomoplasma)u & & 中间原体属(Mesoplasma)l & & & 螺原体科(Spiroplasmataceae)u & & 螺原体属(Spiroplasma)n & & & 支原体目(Mycoplasmatales)l & & & 支原体科(Mycoplasmataceae)u & & (Allobaculum)u & & (Eperythrozoon)u & & (Haemobartonella)u & & 支原体属(Mycoplasma)u & & 脲原体属(Ureaplasma)n & & & 目未定l & & & 丹毒丝菌科(Erysipelothrichaceae)u & & (Bulleidia)u & & 丹毒丝菌属(Erysipelothrix)u & & (Holdemania)u & & (Solobacterium)l & & 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)l & & & 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)n & & & 热脱硫杆菌目(Thermodesulfobacteriales)l & & & 热脱硫杆菌科(Thermodesulfobacteriaceae)u & & (Thermodesulfatator)u & & 热脱硫杆菌属(Thermodesulfobacterium)l & & 热微菌门(Thermomicrobia)l & & & 热微菌纲(Thermomicrobia)n & & & 热微菌目(Thermomicrobiales)l & & & 热微菌科(Thermomicrobiaceae)u & & 热微菌属(Thermomicrobium)l & & 热袍菌门(Thermotogae)l & & & 热袍菌纲(Thermotogae)n & & & 热袍菌目(Thermotogales)l & & & 热袍菌科(Thermotogaceae)u & & (Fervidobacterium)u & & (Geotoga)u & & (Marinitoga)u & & (Petrotoga)u & & (Thermosipho)u & & 热袍菌属(Thermotoga)l & & 疣微菌门(Verrucomicrobia)l & & & 丰祐菌纲(Opitutae)l & & & （注：正确形式似应为Opituti）n & & & 丰祐菌目(Opitutales)l & & & 丰祐菌科(Opitutaceae)u & & 交替球菌属(Alterococcus)u & & 丰祐菌属(Opitutus)n & & & 紫红球菌目(Puniceicoccales)l & & & 紫红球菌科(Puniceicoccaceae)u & & (Cerasicoccus)u & & (Coraliomargarita)u & & (Pelagicoccus)u & & 紫红球菌属(Puniceicoccus)l & & & 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)n & & & 疣微菌目(Verrucomicrobiales)l & & & 疣微菌科(Verrucomicrobiaceae)u & & (Akkermansia)u & & 突柄杆菌属(Prosthecobacter)u & & (Rubritalea)u & & 疣微菌属(Verrucomicrobium)l & & & (Xiphinematobacteraceae)*u & & (Xiphinematobacter)*l & & 门未定n & & & (Jonquetella)l & & & 纤线杆菌纲(Ktedonobacteria)n & & & 纤线杆菌目(Ktedonobacterales)l & & & 纤线杆菌科(Ktedonobacteraceae)u & & 纤线杆菌属(Ktedonobacter)
TA的最新日志
关注三人行微信}